Předmět Bioinformatika (A6M33BIN)
Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu A6M33BIN - Bioinformatika, Fakulta elektrotechnická, České vysoké učení technické v Praze (ČVUT).
Top 10 materiálů tohoto předmětu
Materiály tohoto předmětu
| Materiál | Typ | Datum | Počet stažení |
|---|
Další informace
Cíl
Cílem předmětu je vysvětlit principy algoritmů používaných pro zpracování biologických dat na molekulární úrovni, konkrétně algoritmů používaných pro sekvenování genomů, srovnávání biologických sekvencí (zejm. genů), jejich pravděpodobnostní a gramatické modelování, pro hledání souvislostí mezi primární a vyššími strukturami proteinů, jejich funkcemi a interakcemi, pro analýzu dat vysoce paralelních měření (zejm. genové exprese) a pro systémově-biologické modelování procesů jako je metabolismus a regulace genové exprese. Kurs obsahuje i výklad potřebných pasáží molekulární biologie a základních technologií pro měření dat, jež mají být vykládanými algoritmy zpracovávány.
Literatura
[1] Hunter, L. (2004) Life and Its Molecules: A Brief Introduction. AI Magazine 25(1):9-22.[2] Lesk, AM. (2002). Introduction to Bioinformatics, Oxford Univ Press.[3] Baxevanis, AD., Ouellette, BFF. (eds) Bioinformatics: A Practical Guide to the Analysis of Genes and Proteins, Wiley.[4] Cvrčková, F. (2006). Úvod do praktické bioinformatiky. Praha, Academia.
Požadavky
Znalosti těchto oblastí: algoritmy a datové struktury, třídy složitosti algoritmů, NP úplnost, principy relačních databází a dotazování, základy teorie grafů, automatů a gramatik, základy pravděpodobnosti a statistiky, principy statistických testů.
Garant
Filip Železný
Vyučující
Filip Železný, Jiří Kléma