Předmět Genetika populací - Mgr. (AGA29E)

Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu AGA29E - Genetika populací - Mgr., Fakulta agrobiologie, potravinových a přírodních zdrojů, Česká zemědělská univerzita v Praze (ČZU).

Materiál	Typ	Datum	Počet stažení

Cíl

Předmět má za cíl navázat na základní poznatky obecné genetiky ve sféře genetiky populací a rozšířit je ve smyslu aktivního využití teoretických poznatků při řešení pratických úloh vznikajících při šlechtitelských zásazích v konkrétní populaci. Pozornost je zejména věnována odhadu genetických efektů a parametrů, dále pak práci s malými populacemi a genovými rezervami.

Osnova

PřednáškaÚvod do genetiky populacíGenetické složení populace (frekvence genové, genotypové, Hardy-Weinbergova rovnováha)Změna genových frekvencí ve velkých populacích (migrace, mutace)Změna genových frekvencí ve velkých populacích (selekce)Změna genových frekvencí v malých populacích (idealisovaná populace, inbríding, náhodný genetický drift)Práce s genovými reservami (efektivní velikost populace, popis struktury populace pomocí populačně genetických parametrůPráce s genovými reservami (popis struktury populace pomocí molekulárně genetických parametrů)Genetické efekty a jejich odvození (efekty aditivity, dominance, epistáze)Populačně genetická definice plemenné hodnotyPopulačně genetická definice heterozního efektuProstřeďové efekty a jejich členění (vnější, vnitřní, systematické, nesystematické)Definice genetických parametrů (koeficient opakovatelnosti, dědivosti, genetická korelace)Metody odhadu genetických parametrů Interakce genotyp prostředíCvičeníVztah genetiky populací, obecné genetiky a biometrikyOdvození genových a genotypových frekvencí při Hardy-Weinbergově rovnovázeNarušení genetické rovnováhy migracemi a mutacemiNarušení genetické rovnováhy selekcíZměna genetické rovnováhy v malých populacích (inbríding a genetický drift)Stanovení koeficientu inbrídingu a příbuznostiStanovení průměrné heterozygotnosti a genetické distance v malých populacíchStanovení efektů aditivity, dominance a epistázeModelový odhad plemenné hodnotyOdhad heterózního efektuPůsobení prostřeďových efektů (vnější, vnitřní; systematické, nesystematické)Odhady genetických parametrů (koeficient dědivosti a opakovatelnosti)Odhady genetických parametrů, genetická a prostřeďová korelaceZápočet

Získané způsobilosti

Znalosti:Má hluboké teoretické znalosti nezbytné pro pochopení praktických šlechtitelských opatření. Umí se orientovat v genetické struktuře populací domácích i hospodářských zvířat, dokáže odhadnout účinek jednotlivých faktorů ovlivňující změnu ve skladbě populace. Rozumí podstatě jednotlivých genetických modelů a šlechtitelských opatření, jež vedou ke stabilitě resp. zlepšení jednotlivých vlastností hospodářských i domácích zvířat v nejširším slova smyslu. Dokáže aplikovat poznatky matematické statistiky do šlechtění zvířat. Pozornost je rovněž věnována šlechtění malých populací (genových zdrojů).Dovednosti:Dokáže samostatně navrhnout postupy odhadu jednotlivých genetických parametrů (jednotlivce i populace). Je schopen metodicky připravit postupy při odhadu plemenné hodnoty (polní i staniční test). Umí samostatně připravit a vyhodnotit jednotlivé testy populací. Při konstrukci šlechtitelských programů dokáže tvůrčím způsobem využít genetické proměnlivosti mezi jedinci uvnitř populací i mezi populacemi. Je schopen předvídat reakci jednotlivých populací na selekční tlak v konkrétních podmínkách prostředí, tzn. Rozumí vztahu mezi zdravotním stavem (konstitucí) a výkonností (užitkovostí).Kompetence - komunikace:Absolvent předmětu je schopen působit jak pod vedením, tak v týmové spolupráci. Je schopen jednat v rámci svých odborných znalostí, dovedností a způsobilostí v českém a cizím jazyce s použitím odborné terminologie daného předmětu. Umí srozumitelně a přesvědčivě sdělovat vlastní odborné názory odborníků tak především širší veřejnosti.Kompetence - úsudek:Přistupuje ke své práci tvořivě a iniciativně. Je schopen identifikovat a aplikovat informační zdroje (odborná literatura, dokumenty, databáze, webové stránky apod.) a dále klasifikovat a hodnotit výsledky a závěry odborného a vědeckého výzkumu v koherentní formě v rámci tohoto předmětu i předmětů příbuzných. Je schopen plánovat, podporovat a řídit činnost ostatních členů týmu.

Literatura

ZákladníJazyk výuky: ČeštinaJakubec, V., Bezdíček, J., Louda, F. 2010. Selekce - Inbríding - Hybridizace. Agrovýzkum Rapotín. Rapotín. 382 s. ISBN 9788087144220.Říha, J., Jakubec, V. 2002. Hybridizace hospodářských zvířat s aplikací na masný skot. Zemědělské informace. ÚZPI. Praha. 65 s. ISBN 9788072711178.DoporučenáJazyk výuky: ČeštinaJakubec, V., Říha, J., Majzlík, I., Bjelka, M. 2003. Teorie a praxe selekce hospodářských zvířat. Rapotín. 154 s. ISBN 9788090314320.Falconer, D. S., Mackay, T. F. C. 1996. Introduction to Quantitative Genetics. Prentice Hall. 340 s. ISBN 0582243025.Hart, D. L., Clark, A. G. 2007. Principles of Population Genetics. Sinauer Associated Publishers. 565 s. ISBN 9780878933082.Lynch, M., Walsh, B. 1998. Genetics and analysis of quantitative traits. Sinauer Associated Publishers. USA. 980 s. ISBN 0878934812.Mrode, R. A. 2005. Linear Models for the Prediction of Animal Breeding Values. CABI Publishing. 344 s. ISBN 0851990002.

Požadavky

Žádné

Garant

doc. Ing. Karel Mach, CSc.