Předmět Diagnostické metody v ochraně rostlin - Mgr. (AOA22E)

Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu AOA22E - Diagnostické metody v ochraně rostlin - Mgr., Fakulta agrobiologie, potravinových a přírodních zdrojů, Česká zemědělská univerzita v Praze (ČZU).

Materiál	Typ	Datum	Počet stažení

Cíl

Cílem je naučit studenty prakticky využívat základní laboratorní diagnostické metody v ochraně rostlin. Základní formy výuky: přednášky, laboratorní cvičení, semináře.

Osnova

PřednáškaÚvod, význam a rozdělení diagnostických metodMetody kultivace patogenů na umělých médiích - úvod, rozdělení a složení médiíMetody kultivace patogenů na umělých médiích - postupy determinace patogenůSérologické metody - teorie imunitního systému, metody přípravy antigenů, imunizaceSérologické metody - principy precipitačních a aglutinačních metodSérologické metody - principy imunochemických metod, výhody a nevýhody, ekMolekulární metody - teoretické základy molMolekulární metody - molekulární hybridizace, PCRMolekulární metody - RAPD, RFLPElektronový mikroskop - teorie, metody přípravy vzorkůAnalytické metodyBiologické metodyKombinované metody - imunocytochemické, hybridizace a PCR in situKombinované metody - imunoelektroforetické metodyCvičeníMetody kultivace patogenů na umělých médiích - příprava kultivačních médiíMetody kultivace patogenů na umělých médiích - sběr a příprava rostlinného materiálu, vlastní očkováníMetody kultivace patogenů na umělých médiích - vyhodnocení výsledků, determinace patogenůSérologické metody - provedení kapkové metody a difuze v agaruSérologické metody - přímá ELISASérologické metody - nepřímá a kompetitivní ELISAMolekulární metody - extrakce RNK a DNK z rostlinných vzorkůMolekulární metody - provedení molekulární hybridizaceMolekulární metody - provedení metody PCRElektronový mikroskop - příprava vzorků, zalévání do pryskyřice, krájení ultratenkých řezů a jejich kontrastováníElektronový mikroskop - vlastní prohlížení vzorkůBiologické metody - inokulace rostlinKombinované metody - imunoznačení pro elektronový a optický mikroskopZápočet

Získané způsobilosti

Znalosti:Student zná metody diagnostiky rostlinných patogenů na různých úrovních. Zná principy morfologické, biochemické a molekulárně biologické diagnostiky rostlinných onemocnění. Umí zvolit vhodné techniky k detekci a determinaci významných škodlivých organismů. Student má znalosti o rizicích zavlečení a výskytu karanténních organismů, jejich detekce a determinace.Dovednosti:Umí prakticky detekovat a determinovat významné patogeny rostlin, dokáže vybrat vhodné techniky využitelné pro diagnostiku daného patogena. Dokáže prakticky aplikovat molekulárně biologické metody na úrovni PCR, ELISA či RD pro determinaci vybraných druhů patogenů rostlin.Kompetence - komunikace:Student disponuje znalostmi a dovednostmi dovolujícími jeho vnitrooborovou i mimooborovou komunikaci s dalšími kompetentními osobami což mu umožňuje svoje závěry vyplývající z provedených diagnostických postupů konzultovat a tvořit tak relevantní závěry.Kompetence - úsudek:Student je schopen na základě objektivních okolností posoudit rostlinolékařskou situaci a konstruktivně aplikovat vhodné metody diagnostiky pro konkrétní situaci. Je rovněž schopen zhodnotit výsledky diagnostických postupů a vyvodit z nich příslušné závěry.

Literatura

ZákladníKrčmář M., Břicháček B. (1993) Molekulárně biologické metody ve virologické diagnostice. IVPZ Brno, 87 s.DoporučenáMatthews R.E.F., 1993 Diagnosis of plant virus diseases, CRC Press, 374 s.Foster G.D., Taylor S.C., 1998 Plant virology protocols, Humana Press, 571 s.Hampton R., a kol., 1990 Serological methods for detection and identification of viral and bacterial plant pathogens, APS Press, 389 s.Rickwood D., Hames B.D., 1990 Gel electrophoresis of nucleic acids, IRL Press, 311 s.Sambrook J., Fritsch E. F., Maniatis T. (1989) Molecular cloning a laboratory manual, 2nd ed. Cold Spring Harbor Laboratory Press, New York, 1590 p.

Požadavky

žádné

Garant

prof. Ing. Pavel Ryšánek, CSc.