Předmět Zpracování biologických dat I. (ZEZ85E)

Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu ZEZ85E - Zpracování biologických dat I., Fakulta životního prostředí, Česká zemědělská univerzita v Praze (ČZU).

Materiál	Typ	Datum	Počet stažení

Cíl

Cílem kurzu je vštípit studentům základní pravidla vědecké práce při shromažďování, zpracování, interpretaci a publikaci sebraných dat. Kurz předpokládá znalost základních statistických pojmů a procedur, jejichž možné uplatnění je zde demonstrováno na řadě konkrétních příkladů. Nabyté znalosti studenti využijí jak při prezentaci vlastních výsledků na seminářích a při zpracování diplomové práce, tak zejména v praxi při kritickém posuzování biologických projektů a publikačních výstupů aplikačního charakteru.

Osnova

PřednáškaStruktura biologických datTypy dat, popis souboru, odhad parametrů, testování hypotéz, chyba IAnalýza frekvencíPříkladové studie - t a F testyPříkladové studie - korelace a regresePříkladové studie - Jednocestná ANOVAPříkladové studie - Dvoucestná ANOVAPříkladové studie - vícenásobná regrese, GLMPříkladové studie - nakládání s mnohorozměrnými daty, PCAPříkladové studie - nakládání s mnohorozměrnými daty, nepřímá ordinacePříkladové studie - nakládání s mnohorozměrnými daty, přímá ordinacePříkladové studie - nakládání s mnohorozměrnými daty, Monte Carlo testCvičeníPříklady biologických dat, archivace, generátor náhodných čísel - program ExcelOdhad parametrů - program StatisticaAnalýza frekvencí - procvičovánít test a F test - procvičováníKorelace a regrese - procvičováníJednocestná ANOVA - procvičováníDvoucestná ANOVA - procvičováníVícenásobná regrese a GLM - procvičováníPCA - procvičováníNepřímá ordinace - procvičováníPřímá ordinace - procvičováníUžití Monte Catlo testu - procvičování

Získané způsobilosti

Znalosti:Studenti chápou náročnost správného formulování biologicky smysluplné hypotézy a znají základní statistické procedury, které lze při testování hypotéz využít. Mají přehled o základních zdrojích, z nichž lze čerpat aktuální literaturu a znají software pro výpočetní a statistické analýzy.Dovednosti:Studenti efektivně pracují s aktuální literaturou a na základě rešerše umějí formulovat biologicky smysluplnou hypotézu, kterou lze statisticky testovat. Zvládají správný postup při přípravě dat pro analýzu i jednoduché statistické procedury s použitím standardních statistických programů.Kompetence - komunikace:Student respektuje a zvládá pravidla komunikace v odborném kolektivu. Je v něm schopen detailně zdůvodnit jím navržený postup řešení problému i s metodologickými úskalími, formulovat a obhajovat svůj názor správného postupu při analýze dat.Kompetence - úsudek:Student si uvědomuje úskalí spojená s různými přístupy při sběru a vyhodnocení dat a je schopen na toto téma kriticky diskutovat a navrhovat variantní řešení.

Literatura

ZákladníJazyk výuky: ČeštinaCRAWLEY M.J., 2003 Statistical computing. An introduction to data analysis using S-Plus. J. Wiley & Sons, Chichester, 772 s.LEPŠ J., ŠMILAUER P., 2005 Multivariate analysis of ecological data using CANOCO. Cambridge University Press, Cambridge, 269 s.PEKÁR S., BRABEC M., 2009 Moderní analýza biologických dat. Zobecněné lineární modely v prostředí R. Scientia, Praha, 236 s.R DEVELOPMENT CORE TEAM, 2010 R A language and environment for statistical computing. R Foundation for Statistical Computing, Vienna. Online http//www.R-project.org/.DoporučenáJazyk výuky: ČeštinaFOWLER J., KOHEN L., 1995 Practical statistics for field biology. Wiley & Sons, Chichester, 227 s.SOKAL R.R., ROHLF F.J., 1995 Biometry the principles and practice of statistics in biological research. Freeman, New York, 937 s.TER BRAAK C.J.F., ŠMILAUER P., 2002 CANOCO reference manual and CanoDraw for Windows user's guide software for Canonical Community Ordination. Microcomputer Power, Ithaca, 500 s.ZAR J.H., 1999 Biostatistical Analysis. Prentice-Hall, Upper Saddle River, 662 s.

Požadavky

žádné

Garant

prof. Dr. Mgr. Miroslav Šálek