Předmět Spec. metody mikrobiální molek. ekologie (KBE / 261)
Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu KBE / 261 - Spec. metody mikrobiální molek. ekologie, Přírodovědecká fakulta, Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích (JU).
Top 10 materiálů tohoto předmětu
Materiály tohoto předmětu
Materiál | Typ | Datum | Počet stažení |
---|
Další informace
Obsah
Obsah přednášky:1. Specifika izolace DNA/RNA z různých druhů vzorků2. PCR amplifikace specifických úseků DNA pro jednotlivé skupiny bakterií, Archaeí3. Online databáze (RDP, GenBank, SILVA, atd.)4. DGGE,TGGE - denaturační gradientová elekroforéza, princip a příklady využití5. qPCR - princip metody, absolutní, relativní kvantifikace6. Metody stanovení extracelulárních enzymů (fluorogenní vs. chromogenní substráty)Obsah cvičení:1. Izolace DNA/RNA2. PCR amplifikace specifických úseků DNA3. DGGE (denaturační gradientová elektroforéza) + vyhodnocení gelu4. qPCR + vyhodnocení5. Stanovení aktivit extracelulárních enzymů ve vybraných půdách (MUF-substráty)
Literatura
Brock: Biology of Microorganisms 12. nebo 13. vydání (Madigan, Martinko, Dunlap, Clark). Modern Soil Microbiology, 2. Edice (van Elsas, Jansson, Trevors).
Požadavky
Periodicita: běží každý rokSpeciální kurz doktorského studijního oboru Fyziologie a vývojová biologie, Hydrobiologie a Biologie ekosystémů
Garant
Ing. Jiří Bárta, Ph.D.
Vyučující
Ing. Jiří Bárta, Ph.D.Ing. Jiří Bárta, Ph.D.