Předmět Praktika 454 pyrosekvenování (KBO / 121)
Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu KBO / 121 - Praktika 454 pyrosekvenování, Přírodovědecká fakulta, Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích (JU).
Top 10 materiálů tohoto předmětu
Materiály tohoto předmětu
| Materiál | Typ | Datum | Počet stažení |
|---|
Další informace
Obsah
Obsah cvičení:1) příprava 454 knihovny, testování kvality a kvantifikace2) emulzní PCR, příprava a obohacení templátu pro pyrosekvenaci3) příprava a spuštění pyrosekvenačního běhu4) základní analýza hrubých dat
Literatura
Glenn T.C. (2011): Field guide to next-generation DNA sequencers. Molecular Ecology Resources, 5: 759-769. Hall N. (2007): Advanced sequencing technologies and their wider impact in microbiology. The Journal of Experimental Biology, 209: 1518-1525. Malausa T. et al. (2011): High-throughput microsatellite isolation through 454 GS-FLX Titanium pyrosequencing of enriched DNAlibraries. Molecular Ecology Resources, 11: 638-644. Mardis E.R. (2008): Next-generation DNA sequencing methods. Annual Review of Genomics and Human Genetics, 9: 387-402. Metzker M.L. (2010): Sequencing technologies - the next generation. Nature Reviews Genetics. 11: 31-46. Rothberg J.M. et Leamon J.H. (2008): The development and impact of 454 sequencing. Nature Biotechnology, 26: 1117-1124.
Požadavky
Periodicita: předmět běží v ak. letech začínajících sudým letopočtem (např. 2012/2013)
Garant
Mgr. Jiří KOŠNAR, Ph.D.
Vyučující
RNDr. Alica Chroňáková, Ph.D.Mgr. Jiří KOŠNAR, Ph.D.RNDr. Ing. Lubomír Piálek, Ph.D.