Předmět Vývoj mikrosatelitních markerů (SSR) (KBO / 125)
Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu KBO / 125 - Vývoj mikrosatelitních markerů (SSR), Přírodovědecká fakulta, Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích (JU).
Top 10 materiálů tohoto předmětu
Materiály tohoto předmětu
| Materiál | Typ | Datum | Počet stažení |
|---|
Další informace
Obsah
Obsah cvičení:1) izolace genomové DNA, konstrukce restrikční genomové knihovny2) příprava SSR-obohacené genomové knihovny hybridizací s biotinylovaným oligonukleotidem a následnou izolací produktů hybridizace pomocí streptavidinových magnetických mikročástic3) klonování a amplifikace SSR-obohacené genomové knihovny; sekvenování klonů SSR obohacené genomové knihovny4) navrhování primerů pro amplifikaci SSR lokusů (na základě získaných sekvencí nesoucích SSR motivy)
Literatura
Nunome T., Negoro S., Miyatake K., Yamaguchi H., Fukuoka H. (2006): Protocol for the construction of microsatellite enriched genomic library. - Plant Mol. Biol. Rep. 24: 305-312. Selkoe K.A., Toonen R.J. (2006): Microsatellites for ecologists: a practical guide to using and evaluating microsatellite markers. - Ecology Letters 9, 615-629. Weising K., Nybom H., Wolff K., Kahl G. (2005): DNA Fingerprinting in plants: principles, methods and applications. 2nd ed. Taylor & Francois, Boca Raton. Zane L., Bargelloni L., Patarnello T. (2002): Strategies for microsatellite isolation: a review. - Molecular Ecology 11, 1-16.
Požadavky
Periodicita: předmět běží pouze v ak. roce začínajícím lichým letopočtem (např. 2011/2012)
Garant
Mgr. Jiří KOŠNAR, Ph.D.
Vyučující
Mgr. Jiří KOŠNAR, Ph.D.