Předmět Computat.Chem. and Mol. Model. of Bioin (UCH / 060)

Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu UCH / 060 - Computat.Chem. and Mol. Model. of Bioin, Přírodovědecká fakulta, Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích (JU).

Materiál	Typ	Datum	Počet stažení

Obsah

1.Introduction to quantum theory: Schrödinger equation and its approximations, valence bond theory, wave function. (MK)2.Computational methods of quantum chemistry : ab initio approaches, semiempirical methodscommonly used programs in the computational chemistry. (MK)3.Computational experiments and simulations: classical and ab initio molecular dynamics, Monte Carlo, calculations of statistical and thermodynamics values. (MK,RE)4.Intra- and intermolecular interactions in biomolecules. (RE)5. Empirical force fields, molecular dynamics, homology modeling (RE)6. Biopolymers -Nucleic acids and Proteins: structure and dynamics dominant effects during the process of protein folding, geometrical parameters of polypeptide chain, peptides, docking, combinatorial chemistry, QSAR methods. (RE)7.Structural databases in chemistry and biology: Retrieving of structures, statistical methods, data sorting and handling.(RE)

Literatura

LEACH A., Molecular Modelling: Principles and Applications, Pearson Education EMA, January 2001. YOUNG D., Computational Chemistry, A Practical Guide for Applying Techniques to Real World Problems , John Wiley and Sons Ltd., England 2001.

Garant

doc. Mgr. Martin Kabeláč, Ph.D.

Vyučující

prof. RNDr. Rüdiger Horst Ettrich, Ph.D.doc. Mgr. Martin Kabeláč, Ph.D.Ing. Babak Minofar, Ph.D.