Předmět Úvod do biochemie (UCH / BCH)

Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu UCH / BCH - Úvod do biochemie, Přírodovědecká fakulta, Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích (JU).

Materiál	Typ	Datum	Počet stažení

Obsah

1. Struktura a funkce proteinůAminokyseliny jako základní stavební jednotky proteinůPrimární struktura proteinů: aminokyselinová sekvenceSekundární struktura proteinů: alfa helix, beta-sheets, loops, turnsTerciární struktura: ve vodě rozpustné vs.nerozpustné (membránové) proteinyKvartérní struktura: multipodjednotkové komplexy proteinůAminokyselinová sekvence proteinů určuje trojrozměrnou strukturu proteinu2. Základní biochemické metody studia proteinůČištění proteinů: vysolování, dialýza, chromatodrafie, jednorozměrná a dvojrozměrná elektroforéza, ultracentrifugace, imunochemické metody (Western blotting, ELISA, imunofluorescence)Stanovení aminokyselinové sekvence: N-terminální sekvenace Edmanovým odbouráváním, hmotnostní spektrometrieSyntéza peptidůUrčení trojrozměrné struktury proteinů: NMR, rentgenostrukturní analýza3. Nukleové kyseliny (DNA, RNA) a tok genetické informaceSložení DNA a RNA: cukry, typy bází, tvorba řetězcůStruktura DNA a RNA: dvojitá šroubovice, komplementarita bází, replikaceDNA polymeráza: bílkovina katalyzující tvorbu nového komplementárního řetězceGenová exprese: transformace genetické informace do funkční molekuly (transkripce, translace)Mozaiková struktura eukaryotických genů: exony a introny, splicing4. Základní nástroje pro studium a manipulaci genů a jejich exprese (Tichý)Metody rekombinantní DNA: restrikce a ligace, příprava plasmidů a vektorů pro vpravení DNA do buněk a jejich exprese, syntéza oligonukleotidů, PCRManipulace genů: sledování exprese, vpravení nových genů do organismů (transgenní organismy), odstranění genů a příprava jejich místně řízených mutacíGenomika a proteomika5. EnzymyZákladní charakteristikaTermodynamika enzymové katalýzyKinetika enzymové katalýzy: model Michaelis-Mentenovékoenzymy a vitamínyEnzymová inhibice" kompetitivní, nekompetitivní, irreversibilníStrategie katalýzy, příklady:Regulace enzymové katalýzy: alosterická inhibice, isoenzymy, proenzymy6. SacharidyMonosacharidy jako aldehydy nebo ketony s několika hydroxylovými skupinamiOligosacharidy a polysacharidyVazba sacharidů na jiné makromolekuly, lektiny7. Lipidy a membrányMastné kyselinyTři základní typy membránových lipidů: fosfolipidy, glykolipidy a cholesterolInterakce lipid-protein: membránové proteinyPřenos látek přes membránu, membránové kanály a pumpy8. Principy buněčného metabolismumakroergické vazby, ATP jako univerzální zdroj energie pro biosyntetické reakceregulace metabolismu prostřednictvím regulace množství a katalytické aktivity enzymů a přístupnosti substráturegulace metabolismu signály zvenčí (signal transduction pathways)9. Glykolýza, glukoneogeneze, metabolismus glykogenu, lipidů a mastných kyselinštěpení cukrů jako důležitý zdroj energie: glykolýzaglukoneogenezemetabolismus glycogenumetabolismus lipidů a mastných kyselin10. Metabolismus proteinů, aminokyselin a nukleotidůproteiny, jejich obměnaprincip degradace aminokyselin: odštěpení amoniaku a uhlíkového řetězceprincipy degradace a syntéza nukleotidů11. Citrátový cyklus, dýchací řetězec a oxidativní fosforylacecitrátový cyklusdýchací řetězecoxidativní fosforylace12. Fotosyntézasvětelná fáze fotosyntézytemnotní fáze fotosyntézy (Calvinův cyklus) a pentózový cyklus

Získané způsobilosti

absolventi předmětu získají základní znalosti o struktuře a funkci základních stavebních složek živých organismů a jejich přeměnách na molekulární úrovni

Literatura

Jeremy M. Berg, J.L. Tymoczko, L. Stryer. Biochemistry, The 5th edition. W.H. Freeman and Company New York, 2002. ISBN 0-7167-4684-0.Komenda J., Masojídek J., Tichý M. powerpointová presentace. ÚFB Nové Hrady, 2003. VODRÁŽKA Z.:. Biochemie. Academia Praha, 1996. ISBN 80-200-0600-1.

Požadavky

složení, struktura a funkce sacharidů, lipidů, proteinů a nukleových kyselin. principy regulace jejich katabolických a anabolických reakcí, mechanismus získávání energie v procesech respirace a fotosyntézy

Garant

prof. RNDr. Josef Komenda, CSc.

Vyučující

prof. RNDr. Josef Komenda, CSc.prof. RNDr. Jiří Masojídek, CSc.RNDr. Martin Tichý, Ph.D.prof. RNDr. Josef Komenda, CSc.