Předmět Bioinformatika (BIF)

Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu BIF - Bioinformatika, Agronomická fakulta, Mendelova univerzita v Brně (MENDELU).

Materiál	Typ	Datum	Počet stažení

Obsah

1.Historie a úvod do bioinformatiky (dotace 2/1)2.Molekulární genetika a genomika (dotace 4/2)3.Data v bioinformatice, generování dat, běžné formáty dat (dotace 2/1)4.Bioinformatický software a nástroje, Internet, Biologické databáze (dotace 4/2)5.Analýza sekvence DNA, analýza sekvencí proteinů, hodnocení a vyhledávání podobnosti, strukturní a funkční data (dotace 8/4)6.Fylogenetická analýza (dotace 4/2)Výstupy předmětu:Všeobecné kompetence: -dovednosti spojené s využíváním a zpracováním informací-schopnost analýzy a syntézy-schopnost komunikace slovem a písmem v rodném jazyce-schopnost samostatné práce-vědecko-výzkumné dovednostiOborově specifické kompetence: -Dovednost aplikace nástrojů bioinformatiky v molekulárně biologické laboratorní praxi-Dovednost výpočetní analýzy dat získaných sekvenováním genomu, proteomikou a dalšími metodami molekulární biologie a jejich aplikace.-Schopnost vyhodnocování genomických a proteomických dat-Znalost a dovednost využívání bioinformatických softwarů a molekulárně biologických databází-Znalosti a dovednosti vyhodnocování fylogenetických analýz

Získané způsobilosti

Všeobecné kompetence: -dovednosti spojené s využíváním a zpracováním informací-schopnost analýzy a syntézy-schopnost komunikace slovem a písmem v rodném jazyce-schopnost samostatné práce-vědecko-výzkumné dovednostiOborově specifické kompetence: -Dovednost aplikace nástrojů bioinformatiky v molekulárně biologické laboratorní praxi-Dovednost výpočetní analýzy dat získaných sekvenováním genomu, proteomikou a dalšími metodami molekulární biologie a jejich aplikace.-Schopnost vyhodnocování genomických a proteomických dat-Znalost a dovednost využívání bioinformatických softwarů a molekulárně biologických databází-Znalosti a dovednosti vyhodnocování fylogenetických analýz

Literatura

TypAutorNázevMísto vydáníNakladatelRokISBNZCVRČKOVÁ, F.Úvod do praktické bioinformatikyPrahaAcademia200680-200-1360-1ZBATEMAN, A. -- VALENCIA, A.Bioinformatics (Oxford Journals)onlineZPEVZNER, P. -- SHAMIR, R.Bioinformatics for biologistsCambridgeCambridge University Press2011978-1-107-64887-6ZCLAVERIE, J. -- NOTREDAME, C.Bioinformatics for dummiesHoboken, NJWiley Pub.2007978-0-470-08985-9ZBMC BioinformaticsISSN 1471-2105ZFORSDYKE, D R.Evolutionary bioinformaticsNew York9781441977717, 9781441977700DKRAWETZ, S A. -- WOMBLE, D D.Introduction to bioinformatics : a theoretical and practical approachTotowa, New JerseyHumana Press20021-58829-064-6DMISENER , S M. -- KRAWETZ , S A.Bioinformatics. Methods and protocolsTotowaHumana Press2000DTEXT, I.Bioinformatics linksonline

Požadavky

Zkouška se skládá z písemné části. Písemnou část představuje test ve formě otázek a krátkých odpovědí. Min. úspěšnost 60%.

Garant

doc. Ing. Tomáš Urban, Ph.D.

Vyučující

doc. Ing. Tomáš Urban, Ph.D.