Předmět Genetická diverzita (GEDI)

Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu GEDI - Genetická diverzita, Agronomická fakulta, Mendelova univerzita v Brně (MENDELU).

Materiál	Typ	Datum	Počet stažení

Obsah

1.Genetická diverzita rostlin -- úvod (dotace 2/2) a.Význam genetické diverzity a variability kulturních rostlinb.Floristické říše světa - rozdělení a základní charakteristikac.Světová centra genetické diverzity plodind.Posouzení a ochrana biodiverzity2.Genetické markery (dotace 2/2) a.Základní pojmy a rozděleníb.Molekulární markery - rozdělení a použitíc.DNA markery - význam při studiu genetické diverzityd.Uložení DNA u rostlin a postupy izolace3.Elektroforéza (dotace 2/2) a.Princip gelové elektroforézyb.Elektroforéza nukleových kyselinc.Nejčastější typy gelů4.Restrikční endonukleázy (dotace 2/2) a.Původ restrikčních endonukleázb.Charakteristika restrikčních enzymů, jejich označování a rozděleníc.Metoda RFLP5.Amplifikace nukleových kyselin (dotace 2/2) a.Historie objevu PCRb.Princip, průběh a využití PCRc.Efektivita a faktory ovlivňující průběh PCR6.Klonování DNA (dotace 2/2) a.Význam klonování DNA a základní pojmyb.Vektory pro klonování DNAc.Klonování produktů PCR v plazmidových vektorech7.Náhodná PCR (dotace 2/2) a.Princip vzniku polymorfizmu při náhodné PCRb.Základní typy metod náhodné PCR - RAPD, AP-PCR a DAFc.Přednosti a úskalí náhodné PCRd.Ovlivnění výsledku náhodné PCR8.Analýza mikrosatelitů (dotace 2/2) a.Repetitivní sekvence - rozdělení, charakteristika a rozmístění v rostlinném genomub.Princip SSR polymorfizmuc.Primery pro SSR a jejich izolaced.Interpretace SSR elektroforetogramů9.AFLP (dotace 2/2) a.Základní princip metody AFLPb.Přednosti a nevýhody AFLPc.Vyhodnocení a aplikace AFLP10.Mobilní DNA elementy (dotace 2/2) a.Objev mobilních DNA elementůb.Transpozony a retrotranspozony - charakteristikac.Metody využívající analýzy retrotranspozonů - IRAP a RBIP11.Markery založené na sekvencích DNA (dotace 2/2) a.Automatické sekvenování - principb.Struktura rostlinného genomuc.Často sekvenované oblasti nDNA a cpDNAd.Variabilita a evoluce DNA sekvencíe.Analýza sekvenčních datf.Genové banky a bioinformatika

Získané způsobilosti

Všeobecné kompetence: -dovednosti spojené s využíváním a zpracováním informací-kapacita k učení se-kapacita přizpůsobovat se novým situacím-kapacita vytvářet nové myšlenky (kreativita)-odhodlání k úspěchu-schopnost analýzy a syntézy-schopnost aplikace znalosti v praxi-schopnost komunikace slovem a písmem v rodném jazyce-schopnost komunikovat s experty v jiném oboru-schopnost řešit problémy-schopnost samostatné práce-vědecko-výzkumné dovednosti-základní profesní znalosti-základní všeobecné znalosti-základní výpočetní dovednostiOborově specifické kompetence: -Dovednosti spojené se základními molekulárně genetickými metodami-Schopnost kritického hodnocení vědeckých informací-Schopnost plánovat a provádět experimentální práce-Schopnost prezentovat experimentální výsledky -schopnost vyhodnocení a interpretace molekulárně-biologických analýz-Znalost molekulární podstaty vzniku genetické proměnlivosti-Znalost významu genetické proměnlivosti-Znalosti sofistikovaných laboratorních instrumentálních metod

Literatura

TypAutorNázevMísto vydáníNakladatelRokISBNZFLEGR, J.Evoluční biologiePrahaAcademia200580-200-1270-2ZŠMARDA, J. a kol.Metody molekulární biologieBrnoMasarykova univerzita200580-210-3841-1ZVRÁNOVÁ, M. -- ALLOGGIO, I. -- QABLAN, M. -- VYSKOČIL, M. -- BAUMEISTEROVA, A. -- SLOBODA, M. -- PUTNOVÁ, L. -- VRTKOVÁ, I. -- MODRÝ, D. -- HOŘÍN, P.Genetic diversity of the class II major histocompatibility DRA locus inEuropean, Asiatic and African domestic donkeys2011115ZCIESLAROVÁ, J. -- SMÝKAL, P. -- DOČKALOVÁ, Z. -- HANÁČEK, P. -- PROCHÁZKA, S. -- HÝBL , M. -- GRIGA, M.Molecular evidence of genetic diversity changes in pea (Pisum sativum L.) germplasm after long-term maintenance201158

Požadavky

Předmět je zakončen ústní zkouškou (30 min). Minimum pro absolvování zkoušky je 60% znalostí z přednášek a cvičení.Pro ukončení předmětu je nutné odevzdání pěti protokolů z laboratorních cvičení (3., 5., 7., 9. a 11. týden). Účast na praktických cvičeních je povinná.

Garant

Ing. Pavel Hanáček, Ph.D.

Vyučující

Ing. Pavel Hanáček, Ph.D.