Předmět Laboratoře molekulární genetiky (LMG)

Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu LMG - Laboratoře molekulární genetiky, Agronomická fakulta, Mendelova univerzita v Brně (MENDELU).

Materiál	Typ	Datum	Počet stažení

Obsah

1.Izolace genomové DNA z různých druhů biologických vzorků (manuální a automatická) (dotace 0/8)2.Amplifikace fragmentu vybraného genu pomocí polymerázové řetězové reakce (PCR) pro restrikční analýzu (RFLP metoda) a sekvenování PCR produktu (dotace 0/8) a.+ design primerů pomocí různého software3.Detekce jednonukleotidových polymorfismů ve vybraném genu pomocí metody RFLP (polymorfismus délky restrikčních fragmentů) (dotace 0/8) a.+ výběr vhodných restrikčních endonukleáz pro ověření a testování SNP pomocí software Webcutter4.Ověření genotypu zjištěného restrikční analýzou pomocí sekvenování PCR produktu (dotace 0/8) a.+ softwarové skládání, vyhodnocení a hledání podobností a rozdílů v sekvencích5.Analýza mikrosatelitových markerů pomocí fragmentační analýzy (dotace 0/8)6.Kvantitativní stanovení nukleových kyselin pomocí PCR v reálném čase (dotace 0/8)Výstupy předmětu:Všeobecné kompetence: -schopnost analýzy a syntézy-schopnost aplikace znalosti v praxi-schopnost řešit problémy-schopnost samostatné práce-uvědomění si konceptu kvality-vědecko-výzkumné dovednostiOborově specifické kompetence: -Dovednost identifikovat molekulárně-genetické markery-Dovednost výpočetní analýzy dat získaných sekvenováním genomu, proteomikou a dalšími metodami molekulární biologie a jejich aplikace.-Praktické dovednosti práce v laboratoři molekulární genetiky-Schopnost aplikace poznatků molekulární genetiky ve šlechtění zvířat-Schopnost interpretovat výsledky analytických stanovení-Znalost základních genetických mechanizmů na molekulární a buněčné úrovni

Získané způsobilosti

Všeobecné kompetence: -schopnost analýzy a syntézy-schopnost aplikace znalosti v praxi-schopnost řešit problémy-schopnost samostatné práce-uvědomění si konceptu kvality-vědecko-výzkumné dovednostiOborově specifické kompetence: -Dovednost identifikovat molekulárně-genetické markery-Dovednost výpočetní analýzy dat získaných sekvenováním genomu, proteomikou a dalšími metodami molekulární biologie a jejich aplikace.-Praktické dovednosti práce v laboratoři molekulární genetiky-Schopnost aplikace poznatků molekulární genetiky ve šlechtění zvířat-Schopnost interpretovat výsledky analytických stanovení-Znalost základních genetických mechanizmů na molekulární a buněčné úrovni

Literatura

TypAutorNázevMísto vydáníNakladatelRokISBNZSAMBROOK, J.Molecular clonig, a laboratory manualCold Spring Harbor Laboratory Press19890-87969-309-6ZGRAHAM, C A. -- HILL, A J M.DNA sequencing protocolsTotowa, New JerseyHumana Press20010-89603-716-9ZSTIRLING, D. -- BARTLETT, J M S.PCR protocolsTotowa, N.J.Humana Press20030-89603-627-8ZKWOK, P.Single nucleotide polymorphisms: methods andprotocolsTotowa, New JerseyHumana Press20020-89603-968-4

Požadavky

Zkouška. Zkouška je ústní a trvá 30 minut. Student vysvětlí a obhájí své praktické výsledky své laboratorní práce včetně jejich teoretické podstaty. Dále odpovídá na 2 otázky. Požadují se znalosti v souladu se sylabem. Ke zkoušce je třeba též znalostí z laboratorních cvičení včetně detailního vyhodnocení výsledků. Nutné je odevzdání vypracovaných protokolů z laboratorních cvičení. Účast na všech cvičeních je povinná. Student se musí dopředu připravovat na jednotlivé laboratorní úlohy.

Garant

prof. RNDr. Aleš Knoll, Ph.D.

Vyučující

Ing. Eliška HoreckáIng. Čeněk Horeckýprof. RNDr. Aleš Knoll, Ph.D.