Předmět Základy proteomické analýzy (ZKPRA)
Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu ZKPRA - Základy proteomické analýzy, Agronomická fakulta, Mendelova univerzita v Brně (MENDELU).
Top 10 materiálů tohoto předmětu
Materiály tohoto předmětu
| Materiál | Typ | Datum | Počet stažení |
|---|
Další informace
Obsah
1.Extrakce proteinu (dotace 3/6) a.Denaturační metodyb.Příprava extraktů nativních proteinů (inhibitory proteas, ochrana post-translačních modifikací)c.Frakcionace proteinůd.Purifikace post-translačně modifikovaných proteinů2.Separace proteinů (dotace 3/6) a.Elektroforetické metody (SDS-PAGE, IEF, 2-DE)b.Chromatografické metody (gelová filtrace, chromatografie na reverzní fázi, afinitní chromatografie)3.Hmotnostní spektrometrie (dotace 3/6) a.Principy měkké ionizace (ESI, MALDI)b.Příprava vzorku pro hmotnostní spektrometrii4.Bioinformatika (dotace 3/6) a.Identifikace proteinů pomocí hmotnostní spektrometrie (databázové přístupy, de novo)b.Základy interpretace MS spekterc.Komparativní proteomická analýza (metody kvantifikace proteinů, statistické zpracování)
Literatura
TypAutorNázevMísto vydáníNakladatelRokISBNZAHMED, H.Principles and reactions of protein extraction and purification, and characterizationNew York, USA.CRC Press LLC2004ZČERNÝ, M. -- SKALÁK, J. -- ČERNÁ, H. -- BRZOBOHATÝ, B.Advances in purification and separation of posttranslationally modified proteins20139230 October 2013ZNAVEN, T. -- WESTERMEIER, R.Proteomics in Practice: A Laboratory Manual of Proteome AnalysisVerlagWiley-VCH 2002ZPANDEY, A. -- MANN, M.Proteomics to study genes and genomesonline
Požadavky
Zápočtový test, odevzdání protokolůZápočet se skládá z písemné a ústní části. Písemnou část představuje test ve formě otázek a krátkých odpovědí. Min. úspěšnost 60%.
Garant
prof. RNDr. Břetislav Brzobohatý, CSc.
Vyučující
prof. RNDr. Břetislav Brzobohatý, CSc.Mgr. Hana Černá, Ph.D.Mgr. Martin Černý, Ph.D.