Předmět Bioinformatika I (IV107)

Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu IV107 - Bioinformatika I, Fakulta informatiky, Masarykova univerzita (MU).

Materiál	Typ	Datum	Počet stažení

Cíl

Předmět v oblasti aplikované informatiky, který si klade za cíl otevřít studentům dveře do fascinujícího světa molekul, genů a proteinů. V současnosti dochází k prudkému rozvoji bioinformatikya aplikovaných přístupů převážně v biologii, chemii a medicíně, které vyžadují bioinformatické myšlení a schopnosti (práce s velkým množstvím biologických dat s využitím moderních metod informatiky).Absolvováním předmětu student získá nezbytné minimum znalostí pro pochopení základních biologických problémů, které se (nejlépe) řeší na počítači; pochopí a dokáže aplikovat vybrané přístupy k manipulaci bioinformatických dat.

Osnova

Historie a zaměření bioinformatikyZáklady molekulární biologieOrganizace živé hmotyStruktura a funkce DNAStruktura a funkce proteinůEvoluce na úrovni genů a proteinůData v bioinformaticeGenerování datBěžné formáty datVeřejná sekvenční data a přístup k nimAnalýza sekvence DNAAnalýza sekvencí proteinůHodnocení a vyhledávání podobnostiStrukturní a funkční dataJiná data a analýzyPráce s expresními datyŠtěpení proteinů a hmotnostní spektraAnalýza dat v literatuřePočítačová cvičení (4x): Zdroje dat, podobnostní vyhledávání, zobrazování molekul

Literatura

Understanding bioinformatics. Edited by Marketa Zvelebil - Jeremy O. Baum. New York, N.Y.: Garland Science, 2008. xxiii, 772. ISBN 978-0-8153-4024-9. infoFundamental concepts of bioinformatics. Edited by Dane E. Krane - Micheal L. Raymer. [1st ed.]. San Francisco: Benjamin Cummings, 2003. xiii, 314. ISBN 0-8053-4633-3. info

Požadavky

Kurz je vstupním kurzem do oblasti bioinformatiky pro studenty nebiologických oborů a nemá zvláštní předpoklady.

Garant

doc. RNDr. Aleš Horák, Ph.D.

Vyučující

Ing. Matej Lexa, Ph.D.