Předmět Vizualizace komplexních dat (PA055)
Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu PA055 - Vizualizace komplexních dat, Fakulta informatiky, Masarykova univerzita (MU).
Top 10 materiálů tohoto předmětu
Materiály tohoto předmětu
| Materiál | Typ | Datum | Počet stažení |
|---|
Další informace
Cíl
Studenti se seznámí s komplexními typy dat v bioinformatice i jiných disciplínách, způsoby jejich vizualizace na praktických příkladech v jazyce R a Processing nebo z vědecké literatury.Na konci kurzu dokáží:vysvětlit základní principy a cíle vizualizacepřipravit data pro vizualizacizhodnotit existující vizualizaci z hlediska vhodnosti zvolených prostředkůvytvořit vlastní statickou nebo interaktivní vizualizaci zvolených dat
Osnova
1.Úvod do vizualizace dat2.Výpočtové prostředí R a jeho vizualizační nástroje3.Výpočtové prostředí Processing a jeho vizualizační nástroje4.Potřeba vizualizace a druhy dat v bioinformatice a systémové biologii5.Předzpracování dat (odhad a redukce dimenzí, PCA, shlukování, metriky pro výpočet podobnosti, vícerozměrné škálování)6.Přehled vizualizačních technik (souřadnicové grafy, histogramy, stromy a jiné grafy, mapy, hybridní vizualizace)7.Příklady vizualizace v bioinformatice, systémové biologii (genomy a proteomy, měření exprese, ontologie, signální a metabolické dráhy) a jiných disciplínách
Literatura
Handbook of Data Visualization. ISBN 9783540330363. infoSARKAR, Deepayan. Lattice :multivariate data visualization with R. New York: Springer, 2008. xvii, 265. ISBN 978-0-387-75968-5. infoFRY, Ben. Visualizing Data. Beijing: O'Reilly, 2008. xiii, 366. ISBN 978-0-596-51455-6. info
Požadavky
Základní znalosti programování a zájem o R a Processing (skriptovací a programovací jazyky)
Garant
doc. RNDr. Aleš Horák, Ph.D.
Vyučující
Ing. Matej Lexa, Ph.D.