Předmět Projekt ze systémové biologie (PA183)
Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu PA183 - Projekt ze systémové biologie, Fakulta informatiky, Masarykova univerzita (MU).
Top 10 materiálů tohoto předmětu
Materiály tohoto předmětu
| Materiál | Typ | Datum | Počet stažení |
|---|
Další informace
Cíl
Na konci tohoto kurzu bude student schopen:využít veřejně dostupných biologických dat pro vytvoření počítačového modelu;vytvořit počítačový model biologického systému;aplikovat metody výpočetní systémové biologie za účelem provedení analýzy modelu;vyvozovat hypotézy o modelovaném biologickém systému na základě analýzy modelu
Osnova
Shrnutí základních pojmů: in silico model, základní techniky modelování a analýzy biologických systémů.Výběr témat projektů: projekty z oblasti modelování buněčných procesů bakterií a rostlin, aplikace formálních a matematických metod.Realizace projektů: implementace podpůrných skriptů, provedení experimentů, tvorba závěrečné zprávy.Závěrečná presentace.
Literatura
doporučená literaturaKLIPP, Edda. Systems biology in practice :concepts, implementation and application. Weinheim: Wiley-Vch, 2005. xix, 465 s. ISBN 3-527-31078-9. infoComputational modeling of genetic and biochemical networks. Edited by James M. Bower - Hamid Bolouri. Cambridge: Bradford Book, 2001. xx, 336 s. ISBN 0-262-52423-6. infoneurčenoKLIPP, Edda. Systems biology :a textbook. Weinheim: Wiley-VCH Verlag, 2009. xxi, 569 s. ISBN 978-3-527-31874-2. infoVRIES, Gerda de. A course in mathematical biology :quantitative modeling with mathematical and computational methods. Philadelphia, Pa.: Society for Industrial and Applied Mathematics, 2006. xii, 309 p. ISBN 0-89871-612-8. infoALON, Uri. An Introduction to Systems Biology: Design Principles of Biological Circuits. : Chapman & Hall/Crc, 2006. info
Požadavky
Předmět předpokládá základní znalosti z oblasti modelování a simulace dynamiky biologických systémů. Předchozí absolvování předmětů PB050 a PA054 je vítáno, nikoli však podmínkou. Studenti, kteří absolvovali laboratorní praktika PV225, mohou v tomto předmětu navázat na svá měření vytvořením relevantního počítačového modelu.
Garant
doc. RNDr. Aleš Horák, Ph.D.
Vyučující
RNDr. David Šafránek, Ph.D.