Předmět Bioinformatika I - nukleové kyseliny (Bi5000)
Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu Bi5000 - Bioinformatika I - nukleové kyseliny, Přírodovědecká fakulta, Masarykova univerzita (MU).
Top 10 materiálů tohoto předmětu
Materiály tohoto předmětu
| Materiál | Typ | Datum | Počet stažení |
|---|
Další informace
Cíl
Cílem kurzu je zvládnutí běžných aplikací potřebných pro zpracování a analýzu sekvencí nukleových kyselin a proteinů, především seznámení posluchačů s informačními službami pro molekulární biologii dostupnými na internetu jako jsou molekulárně biologické databáze a nástroje pro jejich využití. Na konci kurzu jsou studenti schopni provádět návrh primerů, párové a mnohonásobné přiložení sekvencí a fylogenetické studie, anotaci nově stanovených sekvencí a přípravu sekvencí pro deponování v databázi.
Osnova
Molekulárně biologické databáze.Sekvencování DNA.Manipulace se sekvenčními daty.Posuzování podobnosti sekvencí.Mnohonásobné přiřazení sekvencí.Srovnávací genomika.Počítačové vyhledávání genů.Vyhledávání motivů u proteinů.Predikce sekundární struktury RNA.Zaslání sekvence do databází.Fylogenetické studie založené na sekvencích DNA a proteinů.Analýza obrazu elektroforetických gelů.
Literatura
CVRČKOVÁ, Fatima. Úvod do praktické bioinformatiky. Praha: Academia, 2006. 150 s. ISBN 80-200-1360-1. infoBioinformatics : methods and protocols. Edited by Stephen Misener - Stephen A. Krawetz. Totowa, New Jersey: Humana Press, 2000. xi, 500 s. ISBN 0-86903-732-0. infoATTWOOD, Teresa K. a David J. PARRY-SMITH. Introduction to bioinformatics. 1st pub. Essex: Longman, 1999. xx, 218 s. ISBN 0-582-32788-1. infoBioinformatics : a practical guide to the analysis of genes and proteins. Edited by Andreas D. Baxevanis - Francis B.F. Ouellette. New York: Wiley-Interscience, 1998. xiv, 370 s. ISBN 0-471-19196-5. info
Požadavky
( Bi4010 Základy molekulární biologie || Bi4020 Molekulární biologie ) && ( NOW ( Bi9060 Bioinformatika II ) || SOUHLAS )Předpokladem je absolvování základní přednášky z molekulární biologie (např. Bi4020).
Garant
doc. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D.
Vyučující
doc. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D.Mgr. Martina Damborská