Předmět Statistické hodnocení biodiverzity (Bi5980)

Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu Bi5980 - Statistické hodnocení biodiverzity, Přírodovědecká fakulta, Masarykova univerzita (MU).

Materiál	Typ	Datum	Počet stažení

Cíl

V závěru pokročilého kurzu analýzy biodiverzity je student schopen:Připravit datový soubor pro analýzu biodiverzitních dat;Vizualizovat různými způsoby strukturu biologických společenstev a jejich biodiverzitu;Popsat biodiverzitu indexy diverzity včetně jejich variability;Aplikovat species-abundance modely včetně jejich na niku orientované varianty;Rozhodnout o použití korektní metody vícerozměrné analýzy biologických společenstev;Interpretovat různé způsoby hodnocení biodiverzity jak z jejich výpočetního, tak ekologického hlediska.Orientovat se v nabídce software pro analýzu biodiverzity.

Osnova

1. Biodiverzita jako pojem. Duální koncept hodnocení biodiverzity. Funkční, genetická, strukturní a taxonomická biodiverzita. Biodiverzita v datech. Biodiverzita v grafech. Publikační možnosti analýzy dat týkajících se diverzity na různých úrovních organizace biologických systémů.2. Indexy diverzity. Druhová bohatost, heterogenita rozložení abundancí v rámci biologických společenstev.3. Ekvitabilita a její hodnocení. Intervaly spolehlivosti pro různé indexy diverzity, aproximace možných maximálních a minimálních hodnot. Rarefaction jako využitelná technika. Numerická realizace výpočtu rarefaction křivek, variabilita ve výpočtu této metody.4. Analýza kumulativních "species-abundance" křivek, hodnocení tzv. Q statistiky. Srovnání se standardními technikami hodnocení biodiversity.5. Species - abundance stochastické modely, typy, algoritmy výpočtu, možnosti grafické prezentace. Příklady. "Niche-oriented species - abundance modelling"6. Využití počítačové simulace při hodnocení biodiversity. Boostraping a Jackknifing jako techniky odhadu variability různých ukazatelů biodiversity.7. Aplikovatelnost parametrických a neparametrických technik při hodnocení biodiversity, parametrické hodnocení biodiversity ve vícerozměrných analýzách.8. Možnosti frakcionace biologických společenstev a následná analýza biodiversity získaných podjednotek.9. Pokročilé metody analýzy dat biodiverzityMarkovovy řetězy jako technika využitelná pro analýzu dat týkajících se biodiversity.Koncept „nestedness“ a jeho využití při analýze dat společenstevAnalýza niky, jejího obsazení a kompetice taxonůADE4, ENFA a další vícerozměrné SW a metody specializované na analýzu dat biodiverzity10. Případové studie.

Literatura

LEGENDRE, Pierre a Louis LEGENDRE. Numerical ecology. 2nd engl. ed. Amsterdam: Elsevier, 1998. xv, 853 s. ISBN 0-444-89249-4. infoJ. H. Zar (1984). Biostatistical analysis. Prentice Hall. New Jersey.KREBS, Charles J. Ecological Methodology. New York: Harper Collins Publishers, 1989. 654 s. ISBN 0-06-043784-7. infoMagurran A.E. (1988) Ecological Diversity and Its Measurement. Cambridge University Press, UK.Jongman, Ter Braak and Van Tongeren (1995). Data analysis in community and landscape ekology, Cambridge University Press, Cambridge

Požadavky

Vzhledem k unikátnosti většiny metod v této oblasti není nezbytné vzdělávání v biostatistických metodách, předpokladem je pouze základní znalost principů statistických testů a provádění odhadů a znalost matematiky v rozsahu střední školy. Naopak nutným předpokladem je znalost populační biologie a ekologie.

Garant

doc. RNDr. Ladislav Dušek, Ph.D.

Vyučující

doc. RNDr. Ladislav Dušek, Ph.D.RNDr. Jiří Jarkovský, Ph.D.RNDr. Simona LittnerováRNDr. Danka Haruštiaková, Ph.D.