Předmět Ekotoxikologie mikroorganismů (Bi6420)

Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu Bi6420 - Ekotoxikologie mikroorganismů, Přírodovědecká fakulta, Masarykova univerzita (MU).

Materiál	Typ	Datum	Počet stažení

Cíl

Studenti po absolvování tohoto kurzu budou vědět o interakcích MO a toxických látek (a dalších stresorů) v životním prostředí. Budou schopni rozlišit specifika, kterými se liší ekotoxikologie MO od ekotoxikologie dalších skupin organismů. Budou schopni zdůvodnit použití MO v ekotoxikologii, výhody a nevýhody jednotlivých přístupů. Budou znát základní metody ekotoxikologie MO (kvantita, aktivita, diverzita ...), jejich principy a interpretace. Budou schopni navrhovat strategii studií pro hodnocení MO v prostředí (voda, půda, testování toxicity či bioindikace), interpretovat a diskutovat výsledky environmentálních studií s mikroorganismy. Budou schopni hodnotit ekotoxicitu a rizika chemických látek či vzorků prostředí vůči mikroorganismům. Budou znát základy problematiky biodegradací a bioremediací pomocí MO.

Osnova

1) Úvodo čem je ekotoxikologie – definice, koncepce a přístupy, interakce toxikantů s biologickými systémy, křivka dávka odpověďmikroorganismy (připomenutí) – definice MO, evoluce, hlavní vlastnosti, metabolismus ...mikroorganismy v ŽP – význam a výskyt, příbuzné obory – ekologie MO a environmentální mikrobiologieekotoxikologie MO jako obor – definice předmětu studia, vztahy k jiným disciplínám, specifika – důvody použití, význam a použitelnost, koncepční přístupy, škála standardizovaných metod ISO, OECD ...2) MO a toxické látkybiodostupnost toxických látek pro MO v prostředí - koncepce biodostupnosti, biodostupnost kovů a organických kontaminantů pro MOvstup toxických látek do MO a povrchové bariéry - cytoplazmatická membrána, buněčná stěna, transportní mechanismyinterakce toxikantů s mikrobiálními buňkami, obrana MO proti toxikantům, toxicita, biodegradace polutantů - kovy, organické polutanty, další polutanty3) Odběry MOze vzorků různých prostředí pro účely analýzy MO4) Sledované parametry mikrobiální ekotoxikologie a působení toxických látek na něčlenění a přehled metodkvantifikace mikroorganismů v ekotoxikologii: mikroskopické techniky, barvení; izolační a kultivační techniky, možnosti a limitace; mikrobiální biomasa, definice, metodika, interpretace; růst mikroorganismů, kinetika, vztah s degradacíaktivity mikroorganismů v ekotoxikologii: biogeochemické cykly, závažnost mikrobiálních aktivit – důsledky jejich ovlivnění toxickými látkamiprocesy spojené s cyklem uhlíku, mineralizace, respirace, metodika, standardní test půdní mikrobiologie, růstová kinetika sledovaná pomocí respirace, příkladyprocesy spojené s cyklem dusíku, fixace dusíku, amonifikace, nitrifikace a celková mineralizace dusíku, denitrifikace, metody a příkladyenzymatické aktivity, dehydrogenázová aktivita, využití v jednoduchých testechbioluminiscence mikroorganismů jako endpoint v ekotoxikologii, ATP a jeho využití v ekotoxikologii, anaerobní aktivity mikroorganismůdiverzita mikroorganismů a její použití v ekotoxikologii: diverzita mikroorganismů, význam, kontext se stavem ekosystému; mikrobiální společenstva, evoluční strategie, vztahy k jiným organismům – symbiózy, mykorhizagenetické a molekulární techniky, extrakce NA ze vzorků prostředí, amplifikace s PCR, genové próby, jednotlivé metody (ARDRA, RFLP, DGGE apod.) – principy a využitíanalýza PLFA, principy, interpretace, příkladyfunkční diverzita, metoda Biolog, postupy, koncepce a interpretace, příklady8. Ekotoxikologie MO v reálném prostředí• specifika reálného prostředí• půda• voda9. Degradace tox. látek MO – biodegradace, bioremediace10. Prezentace seminárních prací

Literatura

doporučená literaturaEnvironmental microbiology. Edited by Raina M. Maier - Ian L. Pepper - Charles P. Gerba. 1st ed. San Diego: Harcourt Brace Jovanovich, 2000. xix, 585 s. ISBN 0-12-497570-4. infoMADSEN, Eugene L. Environmental microbiology :from genomes to biogeochemistry. 1st pub. Malden, MA ;: Blackwell Pub., 2008. ix, 479 s. ISBN 9781405136471. infoMitchell R. (2010): Environmental microbiology. John Wiley and Sons. ISBN 047017790X. pp. 363.BITTON, Gabriel. Encyclopedia of environmental microbiology. New York, N.Y.: John Wiley & Sons, 2002. vi, 1167-1. ISBN 0471360481. infoVARNAM, Alan H. a Malcolm G. EVANS. Environmental microbiology. London: Manson publishing, 2000. 160 s. ISBN 1-874545-78-2. infoATLAS, Ronald M. a Richard BARTHA. Microbial ecology :fundamentals and applications. 4th ed. Menlo Park, California: Addison Wesley Longman, 1997. x, 694 s. ISBN 0-8053-0655-2. infoTechniques in microbial ecology. Edited by Robert S. Burlage. New York: Oxford University Press, 1998. xii, 468 s. ISBN 0-19-509223-6. infoManual of environmental microbiology. Edited by Christon J. Hurst. 1st ed. Washington: ASM Press, 1997. xvii, 894. ISBN 1-55581-087-X. infoneurčenoInsam H., Rangger A. (1997): Microbial communities: functional versus structural approaches. Springer. ISBN 3540624058. pp. 263.Modern soil microbiology. Edited by Jan Dirk van Elsas - Janet Jansson - Jack T. Trevors. 2nd ed. Boca Raton, Fla.: CRC Press/Taylor & Francis, 2007. 646 p., [2. ISBN 9780824727499. infoMicrobiological methods for assessing soil quality. Edited by Jaap Bloem - David W. Hopkins - Anna Benedetti. Cambridge, Mass.: CABI Publishing, 2006. xiii, 307. ISBN 0851990983. infoTATE, Robert L. Soil microbiology. 2nd ed. New York: John Wiley & Sons, 2000. xxiii, 508. ISBN 0-471-31791-8. infoMethods in applied soil microbiology and biochemistry. Edited by Kassem Alef - Paolo Nannipieri. London: Academic Press, 1995. 576 s. ISBN 0-12-513840-7. infoRitz K., Dighton J., Giller K. E. (1994): Beyond the biomass: compositional and functional analysis of soil microbial communities. John Wiley & Sons. ISBN 0471950963. pp. 275.Paul E. A., Clark F. E. (1996): Soil microbiology and biochemistry. Academic Press. ISBN 0125468067. pp. 340.Microorganisms in soils :roles in genesis and functions. Edited by François Buscot - Ajit Varma. New York: Springer, 2005. xxiii, 419. ISBN 3540222200. infoMikrobiální ekologie vody. Edited by Věra Straškrabová. [1. vyd.]. Praha: Ministerstvo životního prostředí ČR, 1996. 119 s. ISBN 80-85368-88-9. infoALEXANDER, Martin. Biodegradation and bioremediation. 2nd ed. San Diego: Academic Press, 1999. xvi, 453 s. ISBN 0-12-049861-8. infoHORÁKOVÁ, Danuška . Bioremediace. Elportál, Brno: Masarykova univerzita, 2007. ISSN 1802-128X. URL info

Požadavky

NOW ( Bi6420c Ekotox. mikroorganismů - cv. )Doporučeno mít základy obecné ekotoxikologie a obecné mikrobiologie

Garant

prof. RNDr. Luděk Bláha, Ph.D.

Vyučující

doc. RNDr. Jakub Hofman, Ph.D.