Předmět Taxonomie prokaryot (Bi6700)

Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu Bi6700 - Taxonomie prokaryot, Přírodovědecká fakulta, Masarykova univerzita (MU).

Materiál	Typ	Datum	Počet stažení

Cíl

Na konci kurzu Taxonomie prokaryot bude student schopen identifikovat prokaryotní mikroorganizmy (domény Archaea a Bacteria) na základě jejich fylogenetickému postavení. Získané poznatky je absolvent kurzu schopen použít v systematice bakterií a samostatně interpretovat získané údaje při typizaci bakteriálních izolátů i při identifikaci neznámých vzorků prokaryotních mikroorganizmů.

Osnova

Bakteriální taxonomie shrnuje fylogenetické postavení prokaryotních mikroorganizmů (domény Archaea a Bacteria) a vytyčuje pojem systematiky (1 přednáška). Zástupci domény Archaea jsou zmíněni jen v základních rysech čeledí a rodů (1 přednáška). Podstatná část kurzu je věnována mikroorganizmům z domény Bacteria, které jsou v tomto kurzu děleny do tří částí. V první je podrobně zmíněna taxonomie různých tříd kmene Proteobacteria (5 přednášek). Druhá část kurzu zahrnuje další kmeny gramnegativních koků a tyčinek - aerobní, fakultativně anaerobní, obligátně anaerobní; pravidelné i nepravidelné (3 přednášky). Poslední třetí část kuru se týká grampozitivních bakterií (kmeny Actinobacteria a Firmicutes) - morfologicky odlišné skupiny bakterií, jako jsou mykobakteria, nokardioformní či mycélium tvořící bakterie nebo sporulující bakterie (4 přednášky).Na konci tohoto kurzu by měli být studenti schopni používat získané fenotypové a fylogenetické údaje ke klasifikaci mikroorganizmů nebo k jejich typizaci. Dále by mohli chápat podobnost nebo příbuznost mezi bakteriálními druhy a měli by být schopni objasnit vnitro- a mezi-druhovou příbuznost.

Literatura

SEDLÁČEK, Ivo . Taxonomie prokaryot. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2007. 270 s. 55-969C-2006 02/58 12Př. ISBN 80-210-4207-9. infoEuzéby, J.P. 2007. List of prokaryotic names with standing in nomenclature. On-line: http://www.bacterio.cict.frGarrity, G.M., Boone, D.R., Castenholz, R.W. (eds.). 2001. Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology. Second edition. Volume One. The Archaea and the Deeply Branching and Phototrophic Bacteria. Springer, USA.Garrity, G.M., Brenner, D.J., Krieg, N.R., Staley, J.T. (eds.). 2005a. Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology. Second edition. Volume Two. The Proteobacteria. Part A Introductory Essays. Springer, USA.Garrity, G.M., Brenner, D.J., Krieg, N.R., Staley, J.T. (eds.). 2005b. Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology. Second edition. Volume Two. The Proteobacteria. Part B The Gammaproteobacteria. Springer, USA.Garrity, G.M., Brenner, D.J., Krieg, N.R., Staley, J.T. (eds.). 2005c. Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology. Second edition. Volume Two. The Proteobacteria. Part C The Alpha-, Beta-, Delta-,and Epsilonproteobacteria. Springer, USA.Balows, A., Trüper, H.G., Dworkin, M., Harder, W., Schleifer, K.-H. (eds.). 1992. The Prokaryotes: A Handbook on the biology of bacteria: ecophysiology, isolation, identification, applications. 2nd ed. New York: Springer-Verlag.Stackebrandt, E. (Ed.) 2006. Molecular Identification, Systematics, and Population Structure of Prokaryotes. Springer, Germany.Priest, F.G., Goodfellow, M. (eds.). 2000. Applied microbial systematics. Kluwer Academic Publisher, Dordrecht, The Netherlands.Goodfellow M. and O Donnell A.G. : Chemical methods in pracarytic systematics., J.Wilea and sons., N.Y., 1994

Požadavky

C3580 Biochemie && Bi4020 Molekulární biologie && Bi4090 Obecná mikrobiologie Zkouška z obecné mikrobiologie, biochemie, základů molekulární biologie.

Garant

doc. RNDr. Ivo Sedláček, CSc.

Vyučující

doc. RNDr. Ivo Sedláček, CSc.