Předmět Speciální metody analýzy mikroorganizmů I. - cvičení (Bi6721c)
Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu Bi6721c - Speciální metody analýzy mikroorganizmů I. - cvičení, Přírodovědecká fakulta, Masarykova univerzita (MU).
Top 10 materiálů tohoto předmětu
Materiály tohoto předmětu
| Materiál | Typ | Datum | Počet stažení |
|---|
Další informace
Cíl
Na konci kursu studenti prokáží praktickou schopnost provádět izolaci DNA, PCR a gelovou elektroforézu ze vzorků bakterií a kvasinek.
Osnova
1. Příprava bakteriálních lyzátů z kultur čeledi Pasteurellaceae.2. Amplifikace tří specifických genů.3. Elektroforéza výsledku, purifikace PCR produktů.4. Elektroforéza po purifikaci, kvantifikace a příprava vzorku pro odeslání k sekvenování.5. Počítačová analýza výsledku sekvenování.6. Izolace genomové DNA z bakteriální kultury Escherichia coli.7. Stanovení koncentrace a čistoty DNA spektrofotometricky.8. Izolace genomové DNA ze vzorku s obsahem Chlamydia trachomatis.9. Orientační stanovení koncentrace a čistoty DNA spektrofotometricky.10. Polymerázová řetězová reakce systémem end-point, gelová elektroforéza.11. Real-time PCR pro Chlamydia trachomatis.12. Izolace DNA z kvasinek (fenol-chloroformová extrakce), gelová elektroforéza.13. PCR ITS regionu pro odlišení komplexu Saccharomyces sensu stricto, gelová elektroforéza.14. Štěpení PCR produktu restrikční endonukleázou, gelová elektroforéza.
Literatura
Green, M.R., Sambrook, F. Molecular Cloning. A Laboratory Manual. 4th ed. Cold Spring Harbor Laboratory Press. 2012 Kopecká, J., Bartoš, M. Speciální metody analýzy mikroorganizmů I, návody ke cvičení, 2014
Požadavky
NOW ( Bi6721 Spec. met. an. mikroorg. I. )Předmět je určen pro studenty, kteří chtějí prakticky zvládnout metodu PCR (polymerázová řetězová reakce).
Garant
prof. RNDr. Zdeněk Hubálek, DrSc.
Vyučující
doc. RNDr. Milan Bartoš, Ph.D.Mgr. Jana Kopecká