Předmět Metody analýzy mikroorganizmů II. (Bi7722)
Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu Bi7722 - Metody analýzy mikroorganizmů II., Přírodovědecká fakulta, Masarykova univerzita (MU).
Top 10 materiálů tohoto předmětu
Materiály tohoto předmětu
| Materiál | Typ | Datum | Počet stažení |
|---|
Další informace
Cíl
Na konci kursu budou studenti seznámeni s využitím pokročilých molekulárně biologicých metod v mikrobiologii. Budou schopni najít vhodný postup při řešení konkrétního problému a interpretovat výsledky.
Osnova
Různé éry studia mikrobiálních buněk. Metody kultivační. Metody nekultivační.Techniky rekombinantní DNA a jejich význam při studiu mikroorganismů.Příprava rekombinantních DNA molekul pro diagnostické účely. Sondy NK, jejich charakterizace a použití.Značení a způsoby detekce sond.Způsoby provedení hybridizace. Hybridizace v roztoku a na pevné fázi. Fluorescentní in situ hybridizace.Mikročipy, jejich konstrukce a jejich použití v mikrobiologii.Amplifikační metody v molekulární diagnostice mikroorganismů. Amplifikace cílové sekvence DNA, amplifikace sondy a signálu neseného sondou.PCR v reálném čase. Detekce amplifikačních produktů v reálném čase. TaqMan sondy, hybridizační sondy, vlásenkové sondy a molekulární majáčky.Enzymy používané při manipulaci s nukleovými kyselinami. Restrikční mapy. Detekce polymorfismů v genomech.Molekulárně typizační metody v mikrobiologii. DNA fingerprinty.Analýza proteinů a proteinové fingerprinty.Různé způsoby sekvencování nukleových kyselin a analýza DNA sekvencí.Analýza mikrobiálních komunit – metagenomika.Využití magnetických mikročástic v molekulární diagnostice mikroorganismů.Využití mikroorganismů pro vyhledávání biologicky účinných látek.Validace laboratorních mikrobiologických metod. Akreditace laboratoří.
Literatura
povinná literaturaŠMARDA, Jan , Jiří DOŠKAŘ , Roman PANTŮČEK , Vladislava RŮŽIČKOVÁ a Jana KOPTÍKOVÁ . Metody molekulární biologie. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2005. 194 s. 1. vydání. ISBN 80-210-3841-1. infodoporučená literaturaMolecular microbiology :diagnostic principles and practice. Edited by David H. Persing. 2nd ed. Washington, DC: ASM Press, 2011. xvi, 936 s. ISBN 9781555814977. infoKlonování genů a analýza DNA :úvod. Edited by T. A. Brown, Translated by Martin Fellner. 1. české vyd. V Olomouci: Univerzita Palackého, 2007. xviii, 389. ISBN 978-80-244-1719-6. info
Požadavky
Výuka je určena zájemcům o pokročilé molekulární genetické a diagnostické metody, které se využívají při analýze mikroorganismů . Předpokladem zapsání předmětu je zkouška z předmětu Molekulární biologie (Bi4020), Obecná mikrobiologie (Bi4090).
Garant
prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc.
Vyučující
doc. RNDr. Milan Bartoš, Ph.D.Mgr. Jana KopeckáMgr. Eva Šebestová, Ph.D.