Předmět Metodologie molekulární taxonomie a fylogeneze hmyzu (Bi7770)
Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu Bi7770 - Metodologie molekulární taxonomie a fylogeneze hmyzu, Přírodovědecká fakulta, Masarykova univerzita (MU).
Top 10 materiálů tohoto předmětu
Materiály tohoto předmětu
| Materiál | Typ | Datum | Počet stažení |
|---|
Další informace
Cíl
Tento předmět je určen především pro studenty magisterského a doktorského studia a měl by jim podat základní přehled o současných molekulárních metodách v současnosti běžně používaných v entomologickém výzkumu. Po jeho ukončení bude student schopen teoreticky i prakticky zvládnout následující témata: Analýza DNA (izolace DNA, PCR, elektroforéza DNA, sekvencování, analýza mikrosatelitů); Metody analýzy (fylogenetická data: metody založené na vzdálenosti, maximální parsimonie, testování vhodných modelů, maximální věrohodnost, bayesovská analýza).
Osnova
Přednášky1. DNA (historie, chem. stavba a vlastnosti, typy DNA, vlastnosti primerů a jejich testování)2. Metody založené na analýzách nukleových kyselin (PCR, MS, RAPD, AFLP, hybridizace)3. Sekvencování DNA4. Barcoding a Tree of Life – využitelnost molekulárních dat, multigenová fylogeneze, práce s databázemi5.Zásady bezpečnosti práce a zacházení s vybavením molekulární laboratořeCvičení - LAB6. Praktické cvičení v laboratoři I (extrakce DNA z hmyzí tkáně)7. Praktické cvičení v laboratoři II (příprava PCR, elektroforéza fragmentů)8. Praktické cvičení v laboratoři III (příprava vzorků na sekvencování, purifikace a sekvencování)9. Praktické cvičení v laboratoři IV (mikrosatelity a fragmentační analýza)Cvičení - PC10. Metody analýzy I (zpracování sekvenčních dat) - analýzy založené na sekvencích fragmentů vybraných genetických markerů11. Metody analýzy II (fylogenetická data) - metody založené na vzdálenosti, maximální parsimonie, maximální věrohodnost, bayesovské metody, výběr evolučních modelů
Literatura
doporučená literaturaZIMA J., MACHOLÁN M., MUNCLINGER P., PIÁLEK J. (2004): Genetické metody v zoologii. Univerzita Karlova v Praze, Karolinum, Praha, 239s. ISBN 80-246-0795-6.ŽUROVEC M. (1999) Molekulární biologie živočichů. Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, Biologická fakulta, 312 s. ISBN 80-7040-333-0.BARRY G.HALL, 2004: Phylogenetic trees made easy. Sinauer Associates, Sunderland, Massachusetts, 221 pp.Rozsypal S. 1998-1999: Úvod do molekulární biologie. Díl 1-2.Sambrook & Russel 2001: Molecular Cloning - A laboratory manual, vol.1-2.
Požadavky
SOUHLAS
Garant
RNDr. Andrea Tóthová, Ph.D.
Vyučující
RNDr. Andrea Tóthová, Ph.D.