Předmět Strukturní bioinformatika (C3210)
Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu C3210 - Strukturní bioinformatika, Přírodovědecká fakulta, Masarykova univerzita (MU).
Top 10 materiálů tohoto předmětu
Materiály tohoto předmětu
| Materiál | Typ | Datum | Počet stažení |
|---|
Další informace
Cíl
Po úspěšném ukončení kurzu bude student schopen: popsat základní strukturní motivy bílkovin a nukleových kyselin; ovládat teoretické principy metod pro předpovídání 3D struktury proteinů; vysvětlit podmíněnost funkce biopolymerů jejich 3D strukturou; demonstrovat praktickou použitelnost výše uvedených principů pro návrhy nových biologicky aktivních molekul.
Osnova
1.Co je strukturní bioinformatika, definice předmětu.2.Jak získat 3-D strukturu molekuly a molekulárního systému3.Základní strukturní motivy v bílkovinách, struktura bílkovin4.Základní strukturní motivy v nukleových kyselinách, struktura nukleových kyselin5.Energie jako klíčový fenomén při předpovědi 3-D struktury6.Molekulová mechanika7.Řešení konformačního problému, konformační prohledávání8.Ukládání 3-D dat v databázích, pdb formát9.Homologní modelování a „threading“10.Molekulární komplexy, docking11.Strukturní bioinformatika a návrhy biologicky aktivních látek12.Návrhy léků na bázi receptoru a farmakoforu
Literatura
Structural bioinformatics. Edited by Philip E. Bourne - Helge Weissig. Hoboken, N.J.: Wiley-Liss, 2003. xix, 649 p. ISBN 0-471-20199-5. info
Garant
prof. RNDr. Jaroslav Koča, DrSc.
Vyučující
prof. RNDr. Jaroslav Koča, DrSc.Mgr. Martin Prokop, Ph.D.Mgr. Ing. Crina-Maria Ionescu, Ph.D.Sushil Kumar Mishra, Ph.D.