Předmět Metody biofyzikální chemie (C5855)

Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu C5855 - Metody biofyzikální chemie, Přírodovědecká fakulta, Masarykova univerzita (MU).

Materiál	Typ	Datum	Počet stažení

Cíl

Studenti v tomto kurzu získají rozsáhlé fyzikálně chemické základy v genomice, proteomice, biotechnologii a bionanotechnologii. Studenti se podrobně seznámí s moderními přístupy v oblasti biofyzikálně-chemického výzkumu, velmi užitečného v biofyzice, biochemii, lékařství, farmacii a potravinářství.Na konci tohoto kurzu bude student schopen:a) porozumět principům biofyzikálních metod,b) vysvětlit moderní principy biofyzikálních metod,c) použít základy fyzikální chemie v biologické praxi,d) nabyté vědomosti použít v přípravě bakalářské práce,e) získané vědomosti využít v teorii (výpočty struktur) a v praxi (experiment, který teoretické výpočty ověří),f) interpretovat nové trendy, taktiky a stratégie biofyzikální chemie.

Osnova

1. Chování biologických makromolekul (nukleových kyselin, proteinů a polysacharidů)2. Biofyzikální chemie buňky a membrán (fyzikální chemie v biologii a biofyzice buňky i buněčných membrán, transport přes membránu)3. Techniky pro studium struktur a funkcí biopolymerů (rozdělení metod, výhody a nevýhody, oblast aplikace, obecný postup řešení struktury biopolymeru pomocí různých technik)4. Úvod do Fourierovských metod (použití Fourierovských transformací v náročných experimentálních metodách, výhoda a matematické zpracování signálů)5. Biologické metody pro analýzu primární, sekundární a terciární struktury biomolekul (chemická metoda sekvenování, PCR)6. Fyzikální metody pro analýzu primární, sekundární a terciární struktury biomolekul (RTG analýza, elektronová mikroskopie, rozptyl světla)7. Spektrální metody pro analýzu primární, sekundární a terciární struktury biomolekul - NK a proteinů (UV-Vis, CD, NMR, MS)8. Elektrochemické metody pro analýzu primární, sekundární a terciární struktury biomolekul - NK a proteinů (elektroforéza, dynamické metody, biosenzory)9. Bioinformatika, genomika a proteomika(databáze, sekvenční analýza, genomy a metagenomy, microarray technologie, protein-protein a protein-DNA interakce)10. Experimentální metody v molekulární biotechnologii I. a II.(izolace, amplifikace, sekvenace a rekombinace DNA), (exprese a izolace proteinů, metody strukturní a funkční charakterizace proteinů)11. Molekulární biotechnologie v medicíně, v ochraně životního prostředí, v průmyslu a v zemědělství (buněčná a genová terapie, tkáňové inženýrství a regenerativní medicína, molekulární diagnostika, vakcíny, biosenzory, bioremediace, biopaliva, ochrana prostředí a dlouhodobě udržitelný rozvoj, využití biomasy, fermentační technologie, biokatalýza ve farmaceutickém a chemickém průmyslu, bílé a šedé biotechnologie v potravinářském průmyslu, genetické inženýrství rostlin a živočichů, klonování, GMO potraviny, biopesticidy).12. Počítačové modelování struktur nukleových kyselin a proteinů (strukturní a funkční význam molekul DNA, RNA, ptoteinů; metody predikce sekundárních struktur biopolymerů)

Literatura

povinná literaturaBiophysical chemistry. Edited by James P. Allen. Hoboken, NJ: Wiley-Blackwell Pub., 2008. xvi, 492 p. ISBN 1405124369. infoCANTOR, Charles R. a Paul R. SCHIMMEL. Biophysical chemistry. Part II, Techniques for the study of biological structure and function. 12th print. New York: W.H. Freeman and Company, 2001. xxix, s. 3. ISBN 0-7167-1189-3. infoCANTOR, Charles R. a Paul R. SCHIMMEL. Biophysical chemistry. Part I, The conformation of biological macromolecules. 11th print. New York: W.H. Freeman and Company, 1999. xxii, 341. ISBN 0-7167-1042-0. infoCANTOR, Charles R. a Paul R. SCHIMMEL. Biophysical chemistry. Part III, The behavior of biological macromolecules. New York: W.H. Freeman and Company, 1980. xxix, s. 8. ISBN 0-7167-1191-5. infodoporučená literaturaBiophysical chemistry of biointerfaces. Edited by Hiroyuki Ohshima. Hoboken: Wiley, 2010. xvi, 547 p. ISBN 9780470169353. info

Požadavky

předchozí absolvování C5850 Základy biofyzikální chemiedoporučuje se současně absolvovat C5856 Metody biofyzikální chemie - seminář

Garant

doc. RNDr. Libuše Trnková, CSc.

Vyučující

doc. RNDr. Libuše Trnková, CSc.RNDr. Mgr. Jozef Hritz, Ph.D.prof. Dr. Jiří Kozelka, PhD.Mgr. Jan Brezovský, Ph.D.Mgr. Antonín Hlaváček, Ph.D.Mgr. Pavel Plevka, Ph.D.doc. RNDr. Zbyněk Prokop, Ph.D.Mgr. Šárka Bidmanová, Ph.D.Mgr. Veronika Štěpánková, Ph.D.Mgr. Zdeněk Farka