Předmět Experimentální onkologie (C7187)

Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu C7187 - Experimentální onkologie, Přírodovědecká fakulta, Masarykova univerzita (MU).

Materiál	Typ	Datum	Počet stažení

Cíl

Na konci předmětu by studenti měli mít přehled o biologii a biochemii nádorové buňky a měli by rozumět mechanismům maligní transformace a šíření nádorů.Měli by být schopni teoreticky aplikovat genomické a proteomické přístupy a používat základní databázové zdroje v experimentální onkologii. Studenti by dále měli být schopni vysvětlit přístupy užívané při produkci a purifikaci proteinů a vývoji protilátek, principy molekulárního klonování, genové terapie a použití terapeutických protilátek. Kromě toho by měli být schopni správně rozhodnout o použití nejvhodnějšího biologického materiálu jako jsou modelové systémy (buněčné linie), lidské tkáně, lidská plasma. Přednášející také poskytnou přehled o onkologické farmakologii včetně vývoje a testování léčiv a o použití virů. Jedna z přednášek bude zaměřena na obecné aspekty spolupráce a kariéry ve vědě.

Osnova

1. Organizační záležitosti a požadavky ke zkoušce (Dr. Bouchal). Fyzikální, chemické a biologické faktory vzniku nádorů: Radiační vlivy, mechanismy účinku chemických karcinogenů, testování mutagenity, virová transformace. Biochemické změny u nádorových buněk, hypoxie, její příčiny a důsledky. Warburgův efekt. Principy účinku cytostatik, léková rezistence. Příklady klinicky užívaných nádorových markerů.17.9.2. Úvod do biologie nádorové buňky (Dr. Hrstka). Mechanismy maligní transformace. Angiogeneze, tvorba metastáz. Významné signální dráhy nádorové buňky; Epidemiologie nádorů. Protein p53, možnosti predikce, potenciální možnosti využití při terapii.24.9.3. Metody experimentální onkologie (Dr. Hrstka). Mapování lidského genomu, funkční genomika, epigenetika Metody založené na PCR. Možnosti čipových analýz. Nová generace sekvencování. Genové inženýrství. Modelové systémy v aplikovaném výzkumu.15.10.-změna4. Použití lidského biologického materiálu ve výzkumu (Dr. Nenutil). Lidské tkáně jako zdroj informací a nástroj k validaci experimentálních biologických modelů. Možnosti použití a metody zpracování tkáňových vzorků pro účely experimentální biologie. Prediktivní a prognostická patologie. Odhad biologických vlastností a prognózy zhoubných nádorů. Biologické prediktory odpovědi na léčbu.8.10.5. Molekulární patologie a koncept personalizované medicíny (Dr. Hrstka). Klinicky využitelné biomarkery, laboratorní techniky, ko-alterace a dysregulace signálních drah, „decision making“, pre-analytické výzvy, biomarkery v klinických studiích.22.10.6. Proteomické přístupy v experimentální onkologii (Dr. Bouchal). Necílená a cílená proteomika, používané kvantifikační přístupy. Funkční studie v onkologickém výzkumu, analýza interakcí protein-protein, vyhledávání biomarkerů, jejich verifikace a validace. Volba biologického materiálu a metod, design studie, statistické vyhodnocení, validace a interpretace dat. Praktické příklady výstupů z proteomických experimentů.29.10.7. Genová terapie (Dr. Müller). Choroby léčitelné pomocí genové terapie. Vektory pro genovou terapii. Perspektivy genové terapie. Viry a jejich využiti v experimentální onkologii. Charakterizace a rozdělení viru. Nádory a viry. Adenovirové a lentivirové vektory. Viry a genová terapie.1.10. - změna8. Proteinové inženýrství (Dr. Müller). Studium protein-protein interakcí. „Phage display“ pro hledání protein-protein interakcí. Analýza aktivity. „Protein engineering“.5.11.9. Vývoj, testování a charakterizace léčiv (drug development) (Dr. Müller). Účinná látka, farmakodynamika, farmakokinetika. Modely používané pro „drug screening“. Knihovny chemických látek versus přírodní produkty. Kvantitativní a strukturní analýza potenciálního léčiva. Racionální vývoj léčiv. Klinické studie.12.11.10. Databázové zdroje a algoritmy v experimentální onkologii (Dr. Bouchal): Praktické použití algoritmů a databází na příkladech – práce s počítačem: NCBI, ExPASy, UniProt, BLAST, predikce sekundární struktury a posttranslačních modifikací proteinů. Human Protein atlas. Oncomine. Epidemiologie zhoubných nádorů v ČR (SVOD).19.11. A9/316 od 18:0011. Příprava a purifikace proteinů (Dr. Vojtěšek). Využití rozličných expresních systémů pro přípravu proteinů. Využití širokého spektra „Tag sekvencí“ při přípravě proteinů. Příprava proteinů pro vývoj monoklonálních protilátek. Příprava proteinů pro funkční studie.26.11.12. Vývoj, charakterizace a produkce protilátek (Dr. Vojtěšek). Teorie přípravy monoklonálních a polyklonálních protilátek. Imunizační schémata, používaná zvířata a vhodné antigeny. Metody přípravy monoklonálních protilátek. Metody přípravy polyklonálních protilátek. Metody charakterizace protilátek. Produkce, purifikace a značení protilátek. Využití protilátek. Oblasti aplikace monoklonálních a polyklonálních protilátek. Základní a aplikovaný výzkum. Humanizace protilátek.3.12.

Literatura

doporučená literaturaObecná patologie nádorového růstu. Edited by Aleš Rejthar - Bořivoj Vojtěšek. 1. vyd. Praha: Grada, 2002. 206 s. ISBN 80-247-0238-X. info

Požadavky

C4182 Biochemie II || Bi4020 Molekulární biologie Předmět je koncipován zejména pro studenty navazujícího magisterského a doktorského studia oborů biochemie a molekulární biologie a genetika. Předpokládají se znalosti na úrovni základních kurzů biochemie a molekulární biologie.

Garant

prof. RNDr. Zdeněk Glatz, CSc.

Vyučující

Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D.Mgr. Roman Hrstka, Ph.D.MUDr. Petr Müller, Ph.D.MUDr. Rudolf Nenutil, CSc.RNDr. Bořivoj Vojtěšek, DrSc.