Předmět Molekulové interakce a jejich úloha v biologii a chemii (F8310)

Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu F8310 - Molekulové interakce a jejich úloha v biologii a chemii, Přírodovědecká fakulta, Masarykova univerzita (MU).

Materiál	Typ	Datum	Počet stažení

Cíl

Předmětu objasňuje moderní pohled na úlohu molekolových interakcí v chemii a biologii. Bodou vysvětleny zákládní molekulové interakce (kovalentní struktura, van der Waalsova interakce, elektrostatické interakce, vodíkové vazby, a další možné doplňkové interakce.). Podrobně bude diskutován vliv solvatace a entropie. Bodou vysvětleny základní možnosti jejich popisu, tj. klasická aproximace pomocí empirických potenciálů, a plný kvantově-chemický popis. Budou uvedeny zakladní experimentální techniky (fyzikálně-chemické metody a rentgenostrukturní analýza) Vše bude rozsáhle ilustrováno na příkladech, zejméne se bude jednat o moderní poznatky o struktuře, dynamice a funkci molekul RNA, s rozsáhlou analýzou funkce ribosomu během syntézy bílkovin.Hlavním cílem předmětu je umožnit studentům- popsat a vysvětlit úlohu molekulových interakcí v chemii a biologii (jak v rámci klasické aproximace tak v kvantově-chemického popisu)- popsat a vysvětlit základní vztahující se experimenty a experimentální techniky.

Osnova

Úloha molekulových interakci a proč jsou duležitéKovalentní strukturaVan der Waalsovy sílyElektrostatické sílyVodíkové vazbyNeaditivita interakcí, indukce a charge transferEmpirický potenciál, molekulová mechanika, molekulová dynamikaKvantově-chemický popisbáze atomových orbitalůElektronová korelacefyzikálně chemické metodyrentgenostrukturní analýzavliv solventu a entropieSupramolekulární systémy v chemiiStruktura bílkovinStruktura DNAprotein-DNA komplexyrevoluce v biologii, struktura, dynamika a funkce RNAprincipy molekulových interakcí v RNAStruktura a funkce velké ribosomální podjednotkyStruktura a funkce malé ribosomální podjednotkyelongační cyklus ribosomuúloha molekulových interací v voluci ribosomální RNAzákladní principy funkce biomolekulárních strojů a jak se liší od makroskopických strojů

Literatura

Computational studies of RNA and DNA. Edited by Jiří Šponer - Filip Lankaš. Dordrecht: Springer, 2006. xi, 636 s. ISBN 1-4020-4794-0. info

Požadavky

specifické předpoklady nejsou

Garant

prof. RNDr. Viktor Brabec, DrSc.

Vyučující

prof. RNDr. Jiří Šponer, DrSc.