Předmět Fyzika biopolymerů (F8510)
Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu F8510 - Fyzika biopolymerů, Přírodovědecká fakulta, Masarykova univerzita (MU).
Top 10 materiálů tohoto předmětu
Materiály tohoto předmětu
| Materiál | Typ | Datum | Počet stažení |
|---|
Další informace
Cíl
Předmět se zaměřuje především na studium fyzikálních interakcí mezi atomy a molekulami biopolymerů. Přednáška se soustřeďuje na popis nejdůležitějších interakcí v biomolekulách, na studium vlivu roztoku a užití molekulového modelování.Po absolvování kurzu bude student schopen:- popsat a vysvětlit základní interakce v biomolekulách- použít své znalosti při řešení praktických příkladů- orientovat se v současných trendech dané problematiky
Osnova
1. elektrostatické interakce ve vakuu: Coulombův zákon, princip superpozice, interakce nábojů, dipólů, rotujících dipólů a indukovaných dipólů, van der Waalsova interakce2. elektrostatické interakce ve vodném prostředí: Poisson-Boltzmannova rovnice, Debye-Hückelova teorie, Debyova stínící délka, Gouy-Chapmanova teorie, fluktuující náboje3. interakce velkých nenabitých částic: Hamakerova konstanta, Derjaguinova aproximace, řešení pro různé geometrie4. entropické interakce: směrové entropické síly, ideální řetězec a jeho deformace, fluktuace membrány5. interakce úbytkem, hydrofobní interakce, DLVO, vodíková vazba, solný můstek, π-interakce6. polymery v solventu: Flory-Hugginsova teorie, směs polymerů7. folding proteinů: nativní kontakty, funnel, helix-coil transition, swelling, crowding8. modely biopolymerů: ab initio, atomový popis a molekulová mechanika, zhrubené simulace9. radiální distribuční funkce, uspořádání látky, strukturní faktor, vazebná konstanta10. solvatace molekul a iontů: vlastnosti a struktura vody, kavitační energie, Bornova solvatační energie
Literatura
doporučená literaturaISRAELACHVILI, Jacob N. Intermolecular and surface forces. 3rd ed. Burlington, Mass.: Academic Press, 2011. xxx, 674 p. ISBN 9780123751829. infoDILL, Ken A. a Sarina BROMBERG. Molecular driving forces :statistical thermodynamics in biology, chemistry, physics, and nanoscience. 2nd ed. New York: Garland Science, 2011. xx, 756 p. ISBN 9780815344308. info
Garant
prof. RNDr. Josef Humlíček, CSc.
Vyučující
RNDr. Robert Vácha, PhD.Mgr. Naděžda Špačková, Ph.D.