Předmět Strukturní biologie: biofyzikální aspekty (FA602)

Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu FA602 - Strukturní biologie: biofyzikální aspekty, Přírodovědecká fakulta, Masarykova univerzita (MU).

Materiál	Typ	Datum	Počet stažení

Cíl

Tato přednáška zprostředkuje studentům vědomosti o fundamentálních biofyzikálních principech, které buňky využívají pro modulaci funkce biopolymerů. Přednáška klade důraz na:i) vysvětlení vztahu mezi funkcí biopolymerů a jejich strukturou a prostředím;ii) vysvětlení principu intra- a intermolekulární fyzikálně chemické signalizace a její modulace enviromentálními vlivy.Po úspěšném absolvování předmětu musí být studenti schopni sestavit komplexní návrh strukturně biologického experimentu na základe komplexního souboru biologických funkčních dat.

Osnova

(1) Úvod do strukturní biologie; (2) Kauzální vztahy mezi strukturou biopolymeru a prostředím a mezi strukturou a funkcí; (3) Funkční význam strukturní symetrie, rytmu, a repetice; (4) Koncept: “Molecular crowding”; (5) Biofyzikální aspekty buněčné signalizace; (6) Strukturní studium nestrukturovaných biopolymerů; (7) Principy studia struktury biopolymeru in vivo; (8) Principy racionálního vývoje léčiv – korelace vztahu in vivo funkce vs in vitro struktura; (9) Biomimetické systémy.

Literatura

doporučená literaturaELIEL, Ernest Ludwig, Samuel H. WILEN a Lewis N. MANDER. Stereochemistry of organic compounds. New York: John Wiley & Sons, 1993. xv, 1267 s. ISBN 0-471-01670-5. infoExner, O. Statistic factors and symmetry numbers. Chemicke listy, 87, 473-483, 1993.Dubois JM, Ouanounou G, Rouzaire-Dubois B. The Boltzmann equation in molecular biology. Prog Biophys Mol Biol. 2009 99(2-3):87-93.Protein intrinsic disorder and oligomericity in cell signaling. Sigalov AB. Mol Biosyst. 2010 Mar;6(3):451-61. Epub 2009 Nov 3. ReviewChebotareva NA, Kurganov BI, Livanova NB. Biochemical effects of molecular crowding. Biochemistry (Mosc). 2004 69(11):1239-51.Uversky VN. Intrinsically disordered proteins and their environment: effects of strong denaturants, temperature, pH, counter ions, membranes, binding partners, osmolytes, and macromolecular crowding. Protein J. 2009 28(7-8):305-25.3D QSAR in drug design. Edited by Hugo Kubinyi - Gerd Folkers - Yvonne C. Martin. Dordrecht: Kluwer Academic Publishers, 1998. vi, 416 s. ISBN 0-7923-4792-7. info3D QSAR in drug design. Vol. 2, Ligand-protein interactions and molecular similarity. Edited by Hugo Kubinyi - Gerd Folkers - Yvonne C. Martin. Dordrecht: Kluwer Academic Publishers, 1998. vi, 416 s. ISBN 0-7923-4790-0. info

Požadavky

Základní znalost metod biomolekulární strukturní analýzy (roentgenová difrakce, NMR a CD spektroskopie, FRET, elektronová mikroskopie) a molekulární biofyziky.

Garant

prof. RNDr. Josef Humlíček, CSc.

Vyučující

Mgr. Lukáš Trantírek, Ph.D.