Předmět Vybrané metody molekulární biologie (KBE / MEMOB)

Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu KBE / MEMOB - Vybrané metody molekulární biologie, Přírodovědecká fakulta, Ostravská univerzita v Ostravě (OU).

Materiál	Typ	Datum	Počet stažení

Obsah

Přednášky: (lichý týden 2 hod.)1) Izolace proteinů a nukleových kyselin, centrifugace2) Elektroforéza proteinů a nukleových kyselin3) Enzymy používané v molekulární biologii (restrikční endonukleázy, polymerázy, nukleázy)4) Denaturace a renaturace DNA, hybridizace, přenos NK a proteinů na membránu.5) Klonování, sestavování genových knihoven, PCR6) Sekvenování DNA, chemické sondy, studium lokálních otevřených struktur DNA, DNA-protein interakcí7) Cílená mutageneze, elektrochemie nukleových kyselinCvičení:1) Úvod, organizace práce a bezpečnost práce v laboratoři2) Štěpení plasmidové DNA restrikčními endonukleázami, sestavení restrikční mapy. Klonování (1. část - štěpení a defosforylace vektorové DNA, fosforylace inzertu).3) Detekce poškození DNA pomocí změny topologického stavu plasmidové DNA. Klonování (2. část - vložení inzertu do vektoru, ligace).4) Sekvenčně-specifická a sekvenčně-nespecifická interakce proteinů s DNA. Klonování (3. část - transformace DNA do kompetentních buněk).5) Elektroforéza proteinů. Přenos proteinů na membránu. Klonování (4. část - selekce narostlých klonů, kultivace vybraných klonů, izolace plasmidové DNA).6) Imunochemická detekce proteinů. Klonování (5. část - selekce klonů obsahujících klonovaný inzert pomocí PCR).7) Náhradní termín, zápočty

Získané způsobilosti

?   chápe podstatu a principy nejčastěji používaných molekulárně-biologických technik?   upevňuje a rozvíjí schopnost praktické práce v molekulárně-biologické laboratoři

Literatura

Ruml, T., Rumlová, M. & Pačes, V. Genové inženýrství. VŠCHT Praha, 2002. Šmarda J., Doškař J., Pantůček R., Růžičková V. & Kostíková J. Metody molekulární biologie. Brno, Masarykova univerzita, 2005. Rosypal S., Doškař J., Petrzik K. & Růžičková V. Úvod do molekulární biologie IV díl. nakladatelství S. Rosypal Brno, 2002. Alberts B., Bray D., Johnson A., Lewis J., Raff M., Roberts K. & Walter P.:. Základy buněčné biologie. Ústí nad Labem: Espero Publishing, 2001. Alcamo I. E. DNA Technology. Academic Press USA, 2001. Mazura I. Speciální metody molekulární biologie. Karolinum - nakladatelství UK, Praha, 2002. Lodish, H., Berk, A., Zipursky, S. L., Matsudaira, P., Baltimore, D. & Darnell, J. Molecular Cell Biology. W. H. Freeman and Company, 4. vydání, 2001. Cooper, G. M. & Hausman, R. E. The Cell: A molecular approach, Sinauer Associates, 4. vydání. 2006.

Požadavky

Požadavky k získání zápočtu:1) Aktivní účast na všech cvičeních2) Odevzdání všech protokolů3) Úspěšné napsání kontrolních testů (aspoň 60% bodů)Vstupní požadavky na studenty: Absolvování Základních cvičení z molekulární biologie nebo Cvičení z biochemie. Absolvování předmětu Molekulární biologie (MOLBI) nebo Obecná biologie (OBEBI, GENZS, MOLGE).

Garant

doc. RNDr. Petr Pečinka, Ph.D.

Vyučující

doc. RNDr. Petr Pečinka, Ph.D.Mgr. Jiří Červeňdoc. RNDr. Petr Pečinka, Ph.D.