Předmět Spektroskopie org. molek.a biol. membrán (KFY / SBISY)

Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu KFY / SBISY - Spektroskopie org. molek.a biol. membrán, Přírodovědecká fakulta, Ostravská univerzita v Ostravě (OU).

Materiál	Typ	Datum	Počet stažení

Obsah

1. Přehled použití spektrálních metod v biologických vědách2. Rentgenová strukturní analýza - základy krystalografie, princip RTG difrakce - mapa hustoty elektronů, aplikace RTG ke studiu struktury makromolekul, Rentgenova fluorescenční spektroskopie, princip metody, popis experimentálního zařízení, příprava vzorků3. Hmotnostní spektrometrie - princip metody, základní uspořádání hmotnostního spektrometru, vybrané typy ionizátorů (EI, ESI, APCI, MALDI atd.), analyzátorů (Q, IT, TOF atd.), interpretace hmotnostních spekter, aplikace hmotnostní spektroskopie se zaměřením na vybrané sekundární metabolity rostlin4. Nukleární magnetická rezonance (NMR) - teorie NMR, Zeemanův jev, přechod mezi hladinami Zeemanova multipletu, spektra NMR, rozdělení metod MNR, experimentální uspořádání NMR, použití NMR v biologických vědách5. Elektronová paramagnetická rezonance (EPR) - teorie EPR, rozštěpení energetických hladin, podmínka rezonance, volné radikály, porovnání EPR a NMR, spektra EPR, rozdělení metod EPR, experimentální uspořádání EPR, použití EPR v biologických vědách6. Optická spektra metaloporfyrinů a karotenoidů - energetické hladiny a popis spekter chlorofylů a jejich metabolitů, spektra hemové skupiny a cytochromů, závislost na redoxním stavu, aplikace, teorie optických spekter karotenoidů, vliv dvojných vazeb na fyzikálně-chemické vlastnosti karotenoidů a energetické hladiny7. Spektroskopie biologických membrán - měření tekutosti membrán pomocí fluorescenční anizotropie, FRAP, měření protonového gradientu na membráně.8. Fotoreceptory, spektroskopie a funkce - základní typy fotoreceptorů, principy fotorecepce, citlivost fotoreceptorů na parametry světelného signálu (spektrální kvalita, kvantita, směr, trvání), fytochromy, kryptochromy, rhodopsiny, spektrální charakteristika, mechanismus funkce a typy, akční spektroskopie, obecné principy a příklady identifikace fotoreceptorů pro některé odezvy. Spektroskopická a funkční charakteristika pigmentů absorbujících UV záření.

Získané způsobilosti

Získá znalosti v oblasti teorie, spekter, měření a použití rentgenové strukturní analýzy, hmotnostní spektroskopie, nukleární magnetické rezonance a elektronové paramagnetické rezonance a znalosti optické spektroskopie metaloporfyrinů a karotenoidů, biologických membrán, fotoreceptorů a vybraných sekundárních metabolitů.

Literatura

VALEUR B., BROCHON J.-C. New trends in fluorescence spectroscopy. Application to chemical and life sciences. Berlin-Heidelberg, 2001. ISBN 3-540-67779-8.ALLAN J.P. et al. Biophysical Chemistry. Wiley-Blackwell, 2008. ISBN 978-1-4051-2436-2.BRITTON G. et al. Carotenoids. Birkhäuser, 2008. ISBN 3-7643-7498-3.HADER D.P., TEVINI M. General Photobiology. Oxford, 1987. ISBN 0-08-032027-9.GRIMM B. et al. Chlorophylls and Bacteriochlorophylls. Springer, 2006. ISBN 978-1-4020-4515-8.DE HOFFMANN E., STROOBANT V. Mass Spectrometry Principles and Applications, Third Edition. John Wiley & Sons Ltd, 2007. ISBN 978 0 470 03310 4.PARSON W.W. Modern Optical Spectroscopy With Exercises and Examples from Biophysics and Biochemistry. Springer, 2007. ISBN 978-3-540-37535-7.BJÖRN L.O. et al. Photobiology. Springer, 2008. ISBN 978-0-387-72654-0.NOBEL P.S. et al. Physicochemical and Environmental Plant Physiology. 4th Edition. Elsevier, 2009. ISBN 978-0-12-374143-1.CARMONA P. et al. Spectroscopy of biological molecules: Modern trends. Dordrecht, 1997. ISBN 0-7923-4685-8.FRANK H.A. et al. The photochemistry of carotenoids. Dordrecht, 1999.

Požadavky

Hodnocení zkoušky: zkouška bude hodnocena na základě znalostí v rozsahu probrané problematiky.Znalosti v rozsahu kurzu KFY/OSPP1 (Optická spektroskopie I)Klasifikace v souladu s platným Studijním a zkušebním řádem OU (1. 9. 2015).

Garant

doc. RNDr. Vladimír Špunda, CSc.

Vyučující

Mgr. Václav KarlickýMgr. Martin Navrátil, Ph.D.Mgr. Jakub Nezval