Předmět Genomika a proteomika (KBI / PGETP)
Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu KBI / PGETP - Genomika a proteomika, Přírodovědecká fakulta, Univerzita Hradec Králové (UHK).
Top 10 materiálů tohoto předmětu
Materiály tohoto předmětu
| Materiál | Typ | Datum | Počet stažení |
|---|
Další informace
Obsah
Definice genomiky, vlastnosti a struktura nukleových kyselin (deoxyribonukleotidy, ribonukleotidy, komplementarita, typy dvoušroubovice)Izolace a separace NK (izolace DNA, izolace RNA, stanovení kvality a kvantity NK, elektroforetická separace NK)Restriktázy, hybridizace NK (typy restrikčních endonukleáz, příklady restrikčního štěpení, Southern blot, nothern blot)PCR - polymerázová řetězová reakce (princip, optimalizace reakce, varianty)Klonování DNA, DNA knihovny (tvorba rekombinantní molekuly DNA, přenos do hostitelské buňky, selekce pozitivních klonů, cDNA vs. genomové knihovny)Metody sekvenování DNA (chemická metoda vs. enzymatická metoda sekvenování, nové postupy)Fyzikální mapování genomu (tvorba restrikčních map, detekce polymorfismů).Analýza genové exprese (transkripce, translace a metody jejich studia)Přehled a zaměření proteomiky (metody, vlastnosti peptidů a proteinů)Zpracování a analýza biologického vzorkuSeparační metody používané v proteomice: chromatografické, elektroforetické a jiné postupy zjednodušení analyzovaných směsíGelová elektroforéza: isoelektrická fokusace, SDS-PAGE, detekce proteinůZáklady hmotnostní spektrometrie: ionizační techniky pro biomolekuly, používané analyzátory, tandemová hmotnostní spektrometriePříprava a purifikace vzorku pro hmotnostně-spektrometrickou analýzuZáklady interpretace hmotnostně-spektrometrických dat, identifikace proteinů metodou peptidového mapování a tandemové hmotnostní spektrometrie, bioinformatické nástroje a databáze používané v proteomice
Literatura
Gibson, G., Muse, V. S. A Primer of Genom Science. Hunt, S. P., Livesey, F. Functional Genomics: A practical Approach. Oxford, 2000. Šmarda a kol. Metody molekulární biologie. Brno, 2005. Primrose, S. B. Principles of Genome Analysis. Oxford, 1995. ISBN 0-86542-946-4.
Požadavky
písemná zkouška
Garant
RNDr. Alena Fučíková, Ph.D.
Vyučující
RNDr. Alena Fučíková, Ph.D.