Předmět Obecná biochemie (GAF141)

Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu GAF141 - Obecná biochemie, Farmaceutická fakulta Hradec Králové, Univerzita Karlova v Praze (UK).

Materiál	Typ	Datum	Počet stažení

Sylabus

Sylabus předmětu1. Proteiny (přehled)Fyzikálně-chemické a biologické vlastnosti aminokyselin. Peptidy a proteiny, obecné vlastnosti, klasifikace a význam pro živý organismus. Struktura a prostorové uspořádání proteinů se zaměřením na funkci. Vztah mezi konformací proteinů a biologickým účinkem.2. EnzymyKlasifikace a význam. Mechanismy a zvláštnosti enzymové katalysy. Enzymová kinetika. Regulace enzymové katalysy. Regulatorní enzymy a možnosti jejich ovlivnění, multienzymové systémy.3. Základy termodynamiky biologických systémů.Katabolické a anabolické metabolické děje (obecně), jejich význam, regulace a lokalizace. Metabolismus obecně. Biologické oxidace. Termodynamika metabolických dějů.4. Metabolismus cukrůMetabolismus glukosy ? glykolysa a glukoneogenesa, jejich průběh, lokalizace a regulace. Substrátová fosforylace. Pentosový cyklus, lokalizace a regulace. Vzájemné přeměny monosacharidů. Glykogen ? syntéza a štěpení, regulace obou dějů. Vztah metabolismu cukrů k ostatním metabolickým dějům. Význam cukrů.5. Metabolismus lipidůNeutrální tuky, štěpení, syntéza, regulace. Mastné kyseliny se sudým a lichým počtem uhlíků, nenasycené mastné kyseliny, jejich oxidační štěpení a syntéza. Lokalizace a regulace. Fosfolipidy a glykolipidy, syntéza, štěpení, význam. Cholesterol, jeho syntéza a regulace syntézy. Vznik žlučových kyselin a steroidních hormonů. Význam lipidů. Vzájemný vztah metabolismu lipidů a cukrů. Ketogeneze. Metabolismus a význam ketolátek.6. Metabolismus aminokyselinObecné metabolické reakce aminokyselin. Močovinový cyklus. Metabolické reakce jednotlivých typů aminokyselin ve vztahu k produktu. Jejich význam energetický i látkový. Schéma syntéz aminokyselin v živočišné buňce. Vztah aminokyselin ke všem metabolickým dějům v buňce.7. Citrátový cyklusEnzymy a reakce citrátového cyklu, regulace, lokalizace a vztah ke všem metabolickým přeměnám živin.8. Dýchací řetězec a oxidační fosforylaceSložky, funkce a význam dýchacího řetězce. Oxidační fosforylace, průběh, regulace a hypotézy vzniku ATP. Možné rozpojovače a inhibitory. Vztah oxidační fosforylace ke všem metabolickým přeměnám živin.9. Metabolismus nukleotidůSyntéza a odbourávání purinových a pyrimidinových bazí. Syntéza ribonukleotidů a deoxyribonukleotidů. Význam a využití nukleotidů.10. Transportní mechanismy a kompartmentaceTransportní mechanismy a jejich význam pro regulace metabolických dějů v organismu. Mitochondrie, jejich uspořádání, lokalizace enzymů a enzymových systémů v mitochondrii. Transport přes vnitřní mitochondriální membránu. Význam dalších organel.11. Biochemie rostlinRozdíly v metabolismu živočišné a rostlinné buňky. Fotosyntéza, primární fotochemické děje, fotofosforylace, Calvinův cyklus, fotorespirace. Glyoxylátový cyklus. Asimilace dusíku a síry.12. Biochemie hemuSyntéza a odbourávání hemu. Žlučová barviva, jejich význam a vylučování.13. Mezibuněčná signalizaceEndokrinní, parakrinní a autokrinní signály. Podrobné vysvětlení mechanismů přenosu informace endokrinními signály a jejich význam pro buňku, intracelulární děje spojené s přijetím signálu. Typy receptorů. Druzí poslové.14. Přehled regulačních mechanismů metabolických cestKompartmentace. Transport. Ovlivnění aktivity enzymů (allostericky, kovalentně). Ovlivnění proteosyntézy.15. NeurochemieNeurotransmitery, základy přenosu nervového vzruchu.16. Základy xenobiochemieEnzymy, které přeměňují látky tělu cizí (monooxygenasy, reduktasy a konjugační enzymy). Možnosti ovlivnění aktivity těchto enzymů a farmakologický dopad těchto vlivů. Indukce. Inhibice. Význam xenobiochemie pro farmaceutickou chemii, farmakologii a toxikologii.Praktická cvičení1. Přehled metod využívaných pro biochemické studie:příprava a zpracování biologického materiálu (homogenizace tkání, centrifugace, ultracentrifugace aj.) chromatografické metody pro dělení a čištění biomolekul fotometrie a spektrofotometrie využívané pro měření aktivit enzymů2. Enzymologie:a) vlastnosti enzymů b) obecné faktory, které ovlivňují aktivitu enzymů (např. pH, teplota). Optimalizace podmínek enzymové reakce in vitro c) kinetika enzymových reakcí d) inhibice a určení typu inhibice Seminářea) Enzymy. Enzymová kinetika. Inhibice. b) Metabolismus živin a jejich vzájemné vztahy c) Regulace metabolických dějů

Literatura

Veselá J., Szotáková B., Dršata J.: Praktické cvičení z obecné biochemie pro farmaceuty. Praha : Karolinum, 1997Stryer L.: Biochemistry. N.Y. : Freeman, 1995Voet D., Voetová J. G.: Biochemie. Praha, Victoria Publ., 1995

Garant

prof. Ing. Vladimír Wsól, Ph.D.