Předmět Molekulární biologie (GB019)
Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu GB019 - Molekulární biologie, Farmaceutická fakulta Hradec Králové, Univerzita Karlova v Praze (UK).
Top 10 materiálů tohoto předmětu
Materiály tohoto předmětu
Materiál | Typ | Datum | Počet stažení |
---|
Další informace
Cíl
studium buněčných procesů na molekulární úrovni, popis biologických makromolekul podílejících se na dědičnosti organismů (DNA, RNA, proteinů), jejich vzájemné interakce a regulace jejich funkce, výklad a praktický nácvik nejdůležitějších experimentálních molekulárních metodik
Sylabus
Přednášky Charakteristika předmětu, modelové organizmy používané v molekulární biologii, definice pojmů - dědičnost, genom, gen, negenová DNA, primární a sekundární struktura DNA, palindromy, denaturace a renaturace DNAProkaryontní a eukaryontní genom - charakteristika a strukturaReplikace DNA u prokaryot a eukaryot - jednotlivé fáze, přehled enzymů replikačního aparátuBuněčný cyklus - molekulární mechanismy regulace, nádorová transformace, buněčná smrtMutace - genové, chromozomové a genomové; spontánní a indukovanéReparace - rozdělení reparačních mechanismů; obecná (homologní) rekombinaceCharakteristika RNA, transkripce a posttranskripční úpravy RNA u prokaryot a eukaryot Translace a posttranslační úpravy proteinů - proteosyntetický aparát, jednotlivé fáze, typy úprav proteinůRegulace genové exprese u prokaryot a eukaryot Metody molekulární biologie Izolace nukleových kyselin; stanovení koncentrace a čistoty NK; restrikční metodyEnzymy experimentálně používané v molekulární biologii ? polymerázy, exonukleázy, endonukleázy, modifikující enzymy, ligázy Polymerázová řetězová reakce (PCR) - princip, jednotlivé fáze, modifikace PCR, kvantifikace nukleových kyselin pomocí PCRGelová elektroforéza - princip, typy gelůSekvenování DNA; hybridizační techniky - principy metodKlonování ? princip, příprava rekombinantní molekuly DNA, metody přenosu rekombinantních molekul, selekce klonů s rekombinantní DNA Geneticky podmíněná onemocnění - typy dědičnosti, přehled významných monogenních dědičných onemocněníNepřímá a přímá molekulárně genetická diagnostika - principy, přehled metodPraktická cvičeníIzolace genomové DNA; fenol-chloroformová extrakce a etanolová precipitace genomové DNA; spektrofotometrické stanovení koncentrace a čistoty genomové DNA Příprava reakční směsi pro PCR a amplifikace vybraného genu metodou PCR Příprava agarózového gelu; separace fragmentů DNA elektroforézou; vizualizace DNA na UV- transiluminátoru
Literatura
Alberts B. a kol.: Základy buněčné biologie - Úvod do molekulární biologie buňky, Espero Publ., Ústí nad Labem, 2000 Holasová Š. a kol.: Praktická cvičení z molekulární genetiky. 1. vydání. Karolinum 2006 Rosypal, S.: Úvod do molekulární biologie - Díl první, Brno, 2006 Rumlová M., Pačes V., Ruml T. Základní metody genového inženýrství - Laboratorní manuál. 1. vydání. JPM Tisk 2003 Zima, T. a kol: Laboratorní diagnostika, Galén, 2002
Požadavky
Témata ke zkoušce z Molekulární biologie3. roč. Zdravotnická bioanalytika, Zimní semestr 2007/20081. Molekulární biologie - předmět studia, modelové organizmy používané v molekulární biologii, dědičnost, genom, gen, negenová DNA2. Prokaryontní, eukaryontní genom3. DNA - struktura, funkce, palindromy, denaturace, renaturace DNA4. Replikace DNA - princip, jednotlivé fáze, enzymy účastnící se replikace, Okazakiho fragmenty, telomery5. Buněčný cyklus, molekulární mechanismy regulace buněčného cyklu, nádorová transformace, buněčná smrt - apoptóza/nekróza6. Mutace - genové, chromozomové a genomové; spontánní a indukované7. Reparace - rozdělení reparačních mechanismů; obecná (homologní) rekombinace8. Exprese genetické informace, centrální ?dogma? molekulární biologie, genom, transkriptom, proteom9. RNA - typy, funkce10. Transkripce - princip, jednotlivé fáze, odlišnosti mezi prokaryonty a eukaryonty11. Promotor, operátor, terminátor, operon12. Posttranskripční úpravy RNA13. Genetický kód14. Proteosyntetický aparát - mRNA, tRNA, ribozómy15. Proteosyntéza - aktivace aminokyselin, průběh translace16. Posttranslační úpravy proteinů, degradace proteinů17. Regulace gen. exprese u prokaryont - negativní a pozitivní regulace operonu18. Regulace gen. exprese u eukaryont - úrovně regulace, interakce regulačních proteinů s NK19. Izolace nukleových kyselin, stanovení koncentrace a čistoty NK20. Restrikční metody21. Enzymy experimentálně používané v mol. biologii - polymerázy22. Enzymy experimentálně používané v mol. biologii - exonukleázy, endonukleázy, modifikující enzymy23. Enzymy experimentálně používané v mol. biologii - ligázy, metody spojování molekul DNA24. PCR - princip reakce, jednotlivé fáze25. PCR - základní složky reakce, optimalizace PCR26. Problematika kontaminace PCR, postupy omezující riziko kontaminace, kontrola kvality PCR27. Modifikace PCR, kvantifikace NK pomocí PCR28. Separace pomocí gelové elektroforézy - princip, typy gelů29. Sekvenování DNA, principy základních metod30. Hybridizace NK - princip, hybridizační sondy, značení a detekce sond31. Hybridizační techniky - hybridizace na pevných podkladech, hybridizace in situ32. Klonování - vysvětlení pojmu, princip, využití, klonovací vektory, příprava rekombinantní molekuly DNA, přenos rekombinantní molekuly DNA do hostitelské buňky, DNA knihovny33. Klonování - selekce klonů obsahujících rekombinantní DNA a analýza klonované DNA34. Typy dědičnosti, zákonitosti přenosu dědičných chorob, rozdělení a přehled významných monogenních dědičných onemocnění35. Nepřímá molekulárně genetická diagnostika - princip, metody, faktory, které ji ovlivňují36. Přímá molekulárně genetická diagnostika - princip, metody
Garant
doc. PharmDr. Tomáš Šimůnek, Ph.D.