Předmět Molekulární biologie (GB169)

Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu GB169 - Molekulární biologie, Farmaceutická fakulta Hradec Králové, Univerzita Karlova v Praze (UK).

Materiál	Typ	Datum	Počet stažení

Cíl

studium buněčných procesů na molekulární úrovni, popis biologických makromolekul podílejících se na dědičnosti organismů (DNA, RNA, proteinů), jejich vzájemné interakce a regulace jejich funkce, výklad nejdůležitějších experimentálních molekulárních metodik

Sylabus

Přednášky, seminářeCharakteristika předmětu, modelové organizmy používané v molekulární biologii, definice pojmů - dědičnost, genom, gen, negenová DNA, primární a sekundární struktura DNA, palindromy, denaturace a renaturace DNA Prokaryontní a eukaryontní genom - charakteristika a struktura Replikace DNA u prokaryot a eukaryot - jednotlivé fáze, přehled enzymů replikačního aparátu Buněčný cyklus - molekulární mechanismy regulace, nádorová transformace, buněčná smrt Mutace - genové, chromozomové a genomové; spontánní a indukované Reparace - rozdělení reparačních mechanismů; obecná (homologní) rekombinace Charakteristika RNA, transkripce a posttranskripční úpravy RNA u prokaryot a eukaryot Translace a posttranslační úpravy proteinů - proteosyntetický aparát, jednotlivé fáze, typy úprav proteinů Regulace genové exprese u prokaryot a eukaryot Metody molekulární biologie Izolace nukleových kyselin; stanovení koncentrace a čistoty NK; restrikční metody Enzymy experimentálně používané v molekulární biologii ? polymerázy, exonukleázy, endonukleázy, modifikující enzymy, ligázy Polymerázová řetězová reakce (PCR) - princip, jednotlivé fáze, modifikace PCR, kvantifikace nukleových kyselin pomocí PCR Gelová elektroforéza - princip, typy gelů Sekvenování DNA; hybridizační techniky - principy metod Klonování ? princip, příprava rekombinantní molekuly DNA, metody přenosu rekombinantních molekul, selekce klonů s rekombinantní DNA Geneticky podmíněná onemocnění - typy dědičnosti, přehled významných monogenních dědičných onemocnění Nepřímá a přímá molekulárně genetická diagnostika - principy, přehled metod

Literatura

Alberts B. a kol.: Základy buněčné biologie - Úvod do molekulární biologie buňky, Espero Publ., Ústí nad Labem, 2000 Holasová Š. a kol.: Praktická cvičení z molekulární genetiky. 1. vydání. Karolinum 2006 Rosypal, S.: Úvod do molekulární biologie - Díl první, Brno, 2006 Rumlová M., Pačes V., Ruml T. Základní metody genového inženýrství - Laboratorní manuál. 1. vydání. JPM Tisk 2003 Zima, T. a kol: Laboratorní diagnostika, Galén, 2002

Požadavky

Témata ke zkoušce z Molekulární biologie 3. roč. Zdravotnická bioanalytika, Zimní semestr 2007/2008 1. Molekulární biologie - předmět studia, modelové organizmy používané v molekulární biologii, dědičnost, genom, gen, negenová DNA 2. Prokaryontní, eukaryontní genom 3. DNA - struktura, funkce, palindromy, denaturace, renaturace DNA 4. Replikace DNA - princip, jednotlivé fáze, enzymy účastnící se replikace, Okazakiho fragmenty, telomery 5. Buněčný cyklus, molekulární mechanismy regulace buněčného cyklu, nádorová transformace, buněčná smrt - apoptóza/nekróza 6. Mutace - genové, chromozomové a genomové; spontánní a indukované 7. Reparace - rozdělení reparačních mechanismů; obecná (homologní) rekombinace 8. Exprese genetické informace, centrální ?dogma? molekulární biologie, genom, transkriptom, proteom 9. RNA - typy, funkce 10. Transkripce - princip, jednotlivé fáze, odlišnosti mezi prokaryonty a eukaryonty 11. Promotor, operátor, terminátor, operon 12. Posttranskripční úpravy RNA 13. Genetický kód 14. Proteosyntetický aparát - mRNA, tRNA, ribozómy 15. Proteosyntéza - aktivace aminokyselin, průběh translace 16. Posttranslační úpravy proteinů, degradace proteinů 17. Regulace gen. exprese u prokaryont - negativní a pozitivní regulace operonu 18. Regulace gen. exprese u eukaryont - úrovně regulace, interakce regulačních proteinů s NK 19. Izolace nukleových kyselin, stanovení koncentrace a čistoty NK 20. Restrikční metody 21. Enzymy experimentálně používané v mol. biologii - polymerázy 22. Enzymy experimentálně používané v mol. biologii - exonukleázy, endonukleázy, modifikující enzymy 23. Enzymy experimentálně používané v mol. biologii - ligázy, metody spojování molekul DNA 24. PCR - princip reakce, jednotlivé fáze 25. PCR - základní složky reakce, optimalizace PCR 26. Problematika kontaminace PCR, postupy omezující riziko kontaminace, kontrola kvality PCR 27. Modifikace PCR, kvantifikace NK pomocí PCR 28. Separace pomocí gelové elektroforézy - princip, typy gelů 29. Sekvenování DNA, principy základních metod 30. Hybridizace NK - princip, hybridizační sondy, značení a detekce sond 31. Hybridizační techniky - hybridizace na pevných podkladech, hybridizace in situ 32. Klonování - vysvětlení pojmu, princip, využití, klonovací vektory, příprava rekombinantní molekuly DNA, přenos rekombinantní molekuly DNA do hostitelské buňky, DNA knihovny 33. Klonování - selekce klonů obsahujících rekombinantní DNA a analýza klonované DNA 34. Typy dědičnosti, zákonitosti přenosu dědičných chorob, rozdělení a přehled významných monogenních dědičných onemocnění 35. Nepřímá molekulárně genetická diagnostika - princip, metody, faktory, které ji ovlivňují 36. Přímá molekulárně genetická diagnostika - princip, metody

Garant

doc. PharmDr. Tomáš Šimůnek, Ph.D.