Předmět Počítačové simulace biomakromolekul (NBCM302)
Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu NBCM302 - Počítačové simulace biomakromolekul, Matematicko-fyzikální fakulta, Univerzita Karlova v Praze (UK).
Top 10 materiálů tohoto předmětu
Materiály tohoto předmětu
| Materiál | Typ | Datum | Počet stažení |
|---|
Další informace
Sylabus
Úvod do základů metod výpočetní chemie Povrchy potenciální energie Metody empirických potenciálů, silová pole, polarizovatelné potenciály Metoda Molekulové Mechaniky - cvičení Metoda Monte Carlo Docking, Flexible Docking Molekulová dynamika, Quenching, Simulated annealing - cvičení Metoda Ewaldovy sumace, PME, LES Pokročilé metody odvozené od molekulové dynamiky, Free energy perturbation - cvičení Metody výpočtu volných energií PROFEC, Chemické Monte Carlo/ MD, MM/PBSA Metoda DFTB + r6 Metody QM/MM, Embeding Počítačové kódy Aplikace na biomolekuly, Drug design, Protein Folding Aplikace na komplexní molekulární systémy Molekulová grafika a vizualizace výsledků Metody 3D stereo vizualizace, rendering - cvičení
Literatura
Schleyer P. v. R.; Allinger, N. L.; Clark, T.; Gasteiger, J.; Kollman, P. A.; Schaefer III, H. F.; Schreiner, P. R., Eds., Encyclopedia of Computational Chemistry (Wiley, Chichester, England), Vol. 1 - 5.
Garant
RNDr. Jaroslav Vacek, CSc.