Předmět Studium struktury a dynamiky makromolekulárních systémů (NFPL041)
Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu NFPL041 - Studium struktury a dynamiky makromolekulárních systémů, Matematicko-fyzikální fakulta, Univerzita Karlova v Praze (UK).
Top 10 materiálů tohoto předmětu
Materiály tohoto předmětu
| Materiál | Typ | Datum | Počet stažení |
|---|
Další informace
Sylabus
1. Úvod do problematiky molekulární biologie Důležitost znalosti detailní struktury makromolekulárních systémů. Příklady ukazující vztah struktury a funkce makromolekulárních soustav. 2. Příprava materiálů pro výzkum Příprava a zdroje biomakromolekul, izolace a čištění biologických materiálů. Příprava systémů vhodných k měření a krystalizace makromolekul, kryokrystalografie 3. Difrakce na krystalických materiálech Opakování základů difrakčních technik, Evaldova konstrukce, odvození základních vztahů mezi strukturou a difrakčním obrazem 4. Difraktometry Různá uspořádání difrakčního experimentu Stanovení strukturních parametrů, symetrie, výpočet strukturních faktorů ~ 5. Synchrotron Metody získávání a vlastnosti synchrotronového záření. Způsoby práce synchrotronu Experimentální technika používaná pro měření difrakce makromolekul Popis a objasnění funkce vybraných experimentálních zařízení instalovaných na zdrojích synchrotronového záření v Evrope a v USA 6. Řešení fázového problému Experimentální měření fází strukturních faktorů, dynamická teorie difrakce Základy statistických metod řešení fázového problému Principy využití anomálního rozptylu při řešení fázového problému ~ 7. Způsoby zpřesňování strukturního modelu Způsoby upřesnění, přesnost a spolehlivost strukturního modelu. Omezující podmínky pro zpřesňování struktury. Důvody a limity využití molekulárního modelování 8. Sledování procesů v reálném čase Základy a podmínky experimentu umožňujícího sledování procesů v časovém rozlišení až 100 ps. Projekt "Free electron laser" 9. Difrakce neutronů Rozdíly mezi difrakcí rtg záření a pomalých neutronů. Příklady praktických aplikací. 10. Příklady praktického využití difrakce synchrotronového záření Strukturní databáze a příklady jejich použití pro objasnění vztahu mezi molekulární strukturou a funkcí - rtg difrakce pri návrhu léciv inhibujících mutantní kmeny HIV proteázy - experimentální a teoretické studium mezimolekulárních interakcí, solvatace makromolekul - studium struktury fázových prechodu u reversní transkriptázy HIV - studium rychlých biochemických reakcí - reakcní dráha uvolnování CO2 z myoglobinu ¨ Praktická cvicení a exkurse - Krystalizacní techniky - Proteinový difraktometr - Molekulární modelování, metody popisu a zobrazování makromolekulárních soustav
Garant
RNDr. Jindřich Hašek, DrSc.