Předmět Multivariační metody v taxonomii (MB120P126)

Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu MB120P126 - Multivariační metody v taxonomii, Přírodovědecká fakulta, Univerzita Karlova v Praze (UK).

Materiál	Typ	Datum	Počet stažení

Sylabus

Porovnanie fenetického a kladistického (parsimonického) prístupu k rekonštrukcii evolučných vzťahov, ich výhody a nevýhody, možnosti alternatívnych prístupov (metóda najväčšej vieryhodnosti, Bayesova metóda); prehľad multivariačných metód používaných v taxonómii; osobitosti geometrickej morfometriky. Klasifikácia znakov a ich použitie; koeficienty vyjadrujúce vzťahy medzi znakmi alebo objektmi; genetické vzdialenosti; štandardizácia a transformácia dát. Zhluková analýza; metódy zhlukovej analýzy, výhody a nevýhody jednotlivých metód; zhody (ties). Ordinačné metódy; analýza hlavných komponentov (PCA), geometrická interpretácia, typy PCA; analýza hlavných koordinát; nemetrické mnohorozmerné škálovanie, stres. Diskriminačná analýza, požiadavky na dáta; kanonická diskriminačná analýza; klasifikačná diskriminačná analýza, klasifikačné pravidlá; kroková diskriminačná analýza. Analýza tvaru, geometrická morfometrika; význačné body (landmarks); Booksteinove súradnice tvaru; Prokrustova analýza; metóda ohybných páskov (thin plate spline), deformácie; obrysová analýza (analýza vlastných tvarov, Fourierova analýza).

Literatura

Bookstein, F.L. 1991: Morphometric tools for landmark data: geometry and biology. Cambridge University Press, New York.Hebák, P., Hustopecký, J., Jarošová, E. & Pecáková, I. 2007: Vícerozměrné statistické metody (1). Ed. 2. Informatorium, Praha.Hebák, P., Hustopecký, J. & Malá, I. 2005: Vícerozměrné statistické metody (2). Informatorium, Praha.Hebák, P., Hustopecký, J., Pecáková, I., Průša, M., Řezanková, H., Svobodová, A. & Vlach, P. 2007: Vícerozměrné statistické metody (3). Ed. 2. Informatorium, Praha.Legendre, P. & Legendre, L. 1998: Numerical ecology. Second English edition. Elsevier, Amsterdam.Lepš, J. & Šmilauer, P. 2003: Multivariate analysis of ecological data using CANOCO. Cambridge University Press, Cambridge, etc.Macleod, N. & Forey, P. 2002: Morphology, shape and phylogeny. Taylor and Francis, London, New York. Macholán, M. 1999: Prokrustes, deformace a nová morfometrie. Vesmír 78: 35-39.Marcus, L.F., Corti, M., Loy, A., Naylor, G.J.P. & Slice, D.E., eds., 1996: Advances in morphometrics. NATO ASI Series A: Life Sciences 284.Marhold, K. & Suda, J. 2002: Statistické zpracování mnohorozměrných dat v taxonomi (fenetické metody). - Karolinum, Praha. Podani, J. 2000: Introduction to the exploration of multivariate biological data. Backhuys Publishers, Leiden.

Požadavky

písemný test a ústní zkouška

Garant

prof. RNDr. Karol Marhold, CSc.

Vyučující

Mgr. Tomáš Fér, Ph.D.prof. RNDr. Karol Marhold, CSc.