Předmět Molekulární evoluce rostlin (MB120P79)
Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu MB120P79 - Molekulární evoluce rostlin, Přírodovědecká fakulta, Univerzita Karlova v Praze (UK).
Top 10 materiálů tohoto předmětu
Materiály tohoto předmětu
| Materiál | Typ | Datum | Počet stažení |
|---|
Další informace
Sylabus
Blok 1. Rostlinné geny a genomy1. Úvod. Struktura DNA a chromozomu. Replikace, transkripce, translace, reverzní transkripce. Struktura genu. Typy rostlinných genomů.2. Chloroplastový genom, jeho evoluce u nižších a vyšších rostlin. Příklady genů a intergenových oblastí užívaných jako markery v populační genetice a v rostlinné fylogenetice.3. Mitochondriální genom, jeho evoluce. Rekombinace a mutace, přenos genů z mtch genomu do jádra a chloroplastu. Srovnání evoluce mitochondriálního a chloroplastového genomu u vyšších rostlin.4. Jaderný genom vyšších rostlin. Transpozony a retropozony, jejich aktivace a umlčení. Mechanismy genové duplikace. 5. Polyploidizace a její genetické důsledky. Auto- a allopolyploidi. Silencing a změna funkce genů. Chování repetitivních sekvencí při polyploidizaci. Recentní a dávní polyploidi. Příklady z okruhu vyšších rostlinBlok 2. Analýza sekvencí 6. Princip sekvenování, editace sekvencí, alignment. BLAST, FASTA, GenBank, CLUSTALX7. Praktikum ? BLAST, alignment atd. v počítačové učebně8. Genetická vzdalenost, korekce mnohonasobne substituce (multiple hit), kdy je vhodné kterou korekci použít.9. Kodujici a nekodujici sekvence, typy dendrogramů - MP, ML10. Neutralita vs. selekce (Tajima D, HKA), užití při hledání vhodných markerů adaptace11. Diskuse publikací (molekulární evoluce vyšších rostlin) ? studenti debatují nad připravenými referáty se současné odborné literatury.Blok 3. Ontogeneze a evoluce12. Ontogeneze vyšších rostlin. Molekulární základy regulace vegetativního růstu rostlin, genetická determinace meristému a rostlinných orgánů13. Indukce kvetení a ontogeneze květu. ABC model. Fylogeneze genu LEAFY u suchozemských rostlin14. Molekulární základy rostlinné reprodukce. Pylová selfinkompatibilita. Gynodiecie, oddělená pohlaví a pohlavní chromozomy rostlin15. Evo-devo, aneb syntéza studia ontogeneze a evoluce- nový směr v evoluční genetice rostlin; příklady.
Literatura
Wen-Hsiung Li: Molecular evolution, Sinauer 1997Vybrané kapitoly
Požadavky
Písemná a ústní zkouška je založena na řešení konkretních problémů. Podmínkou úspěchu je kritický rozbor jedné publikace z oboru, která bude studentovi zadána.
Garant
doc. RNDr. Helena Štorchová, CSc.
Vyučující
doc. RNDr. Helena Štorchová, CSc.