Předmět Vybrané kapitoly z bakteriologie (MB140P32)

Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu MB140P32 - Vybrané kapitoly z bakteriologie, Přírodovědecká fakulta, Univerzita Karlova v Praze (UK).

Materiál	Typ	Datum	Počet stažení

Sylabus

Přednášející: IK: Ivo Konopásek, JB: Jana Beranová, RF: Radovan Fišer, GS: Gabriela Seydlová 1. Regulace u bakterií (IK) Regulace syntézy enzymuRegulace aktivity enzymu 2. Globální regulace (IK)Globální regulace: odpověď na environmentální stresStringentní odpověď a limitace zdrojem uhlíkuLimitace zdrojem dusíkuLimitace fosfátemRegulace přechodu mezi aerobním a anaerobním metabolizmem  3. Environmentální stres a taxe (IK) RpoS a globální stresová odpověďSigma faktory a regulace stresové odpovědiTeplotní šokChladový šokOxidační stresQuorum sensingOsmotický šokChemotaxe 4. Dvoukomponentové systémy u bakterií (JB)Základní charakteristika a struktura TCSHistidin kinázy TCSTypy, varianty a struktura funkčních doménRegulátory odpovědiEfektorové a regulační doményVnímání signálů prostřednictvím TCSPhosphotransfer vs.phosphorelayRegulace TCSKonkrétní příklady-jednoduchý TCS DesK/DesR (B. subtilis)Komplexní phosphorelay-BvgS/BvgA/BvgR (Bordetella) 5. Bakteriální proteinové toxiny (RF) Toxiny účinkující jako superantigeny    příbuznost superantigenů     mechanismus účinku (vazba)     příklady + producenti:         SEA, SEB, SECn, SED, SEE, SEG, SEH (Staphylococcus aureus)         SPEA, SPEC (Streptococcus pyogenes)         SPEB (streptococcal pyrogenic exotoxin B)         SMEZ (str. mitogenic exotoxin Z)         MAM (T-cell mitogen Mycoplasma arthritidis) Toxiny narušující buněčnou membránu (PFT)    Obecný mechanismus účinku     Společné vlastnosti PFT     Pracovní rozdělení:     RTX toxiny (G+ / G- bakterie)         CyaA - (Bordetella pertussis)         HlyA - (Escherichia coli)     "malé" PFT (G+ bakterie)         alfa toxin (Staphylococcus aureus)     "velké" PFT (G+ bakterie)         Společné vlastnosti         Specifická interakce s membránou         Změny konformace monomeru         Tvorba oligomeru         příklady + producenti:          PFO - perfringolysin O (Cl. perfringens)         SLO - streptolysin O (Str. pyogenes)         PLY - pneumolysin (Str. pneumonie)         LLO - listeriolysin O (L. monocytogenes) Přístupy studia toxinů tvořících póry (PFT)     In vitro - výhody přístupu, co vše se dá studovat         Modelový systém černých lipidických membrán (elektrofyziologie)         Studium PFT pomocí liposomů (fluorescence)         Systém kapiček a hydrogelu (elektrofyziologie + fluorescence)     In vivo - Sledování hladiny Ca2+ (fluorescence)6. Život bakterií v biofilmu (JB)Základní charakteristika a výskyt biofilmuFyziologie buněk v biofilmuExtracelulární matrixVývoj a disperze biofilmuSignály ovlivňující tvorbu biofilmuVícedruhový biofilm 7. Lipidy v membráně bakterií (GS)Druhy bakteriálních lipidů (polární hlavy, mastné kyseliny, primární struktura)Membránové modelyNeannulární lipidyAnnulární lipidy - vliv na funkci membránových proteinůFunkce acidických fosfolipidů v membráněFunkce fosfatidylethanolaminu v membráněMembránové lipidy jako cíl antibiotik 8. Bacillus subtilis -diferenciace a mnohobuněčnost (GS)Charakteristika Bacillus subtilisDiferenciace - buněčné typy a determinace osudu buňkySignály spouštějící diferenciaciRegulace heterogenity genové exprese

Literatura

Kim B.H., Gadd, G.M.: Bacterial Physiology and Metabolism, Cambridge University Press, 2008 Moat A.G.,, Foster J.W., Spector M.P., Microbial Physiology, 4th Edition Wiley-Blackwell; 2002 White D., Drummond J., Fuqua C. : The Physiology and Biochemistry of Prokaryotes, Oxford University Press, 2011, 4th edition Encyclopedia of Microbiology , 3ed, Editor-in-Chief:  Moselio Schaechter, Elsevier, 2009 The Prokaryotes, Springer; 3rd edition (2006) Madigan, Martinko, Dunlap, Clark: Brock Biology of Microorganisms, Benjamin Cummings; 13 edition (2010) Vybrané přehledové články z : Nature Reviews Microbiology, Annual Reviews of Microbiology

Požadavky

Zkouška je písemná. Vychází z prezentací přednášek a z doporučené literatury.

Garant

doc. RNDr. Ivo Konopásek, CSc.