Předmět Genomické metody (MB151P102)
Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu MB151P102 - Genomické metody, Přírodovědecká fakulta, Univerzita Karlova v Praze (UK).
Top 10 materiálů tohoto předmětu
Materiály tohoto předmětu
| Materiál | Typ | Datum | Počet stažení |
|---|
Další informace
Sylabus
Témata přednášek:- microarrays, next generation sequencing - jak fungují, možnosti využití, jejich přednosti a limitace- analýzy genomu, transkriptomu, translatomu...- genetické interakce - knihovny (delečních) mutantů, synthetic genetic array, siRNA screens, mapování funkční architektury buňky- chemical genetics - hledání cílů pro nové terapie- epigenomika - chromatinové modifikace, metylace DNA- analýza 3D jaderné architektury - metody chromosomal conformation capture- metagenomické analýzy - analýza environmentálních vzorků, složení mikrobiálních společenstev- nástroje pro zpracování a analýzu genomických dat - Galaxy, R & Bioconductor, Biopython/BioPerl- vizualizace genomických dat- integrace dat z různých metod- databáze pro "omics" dataPraktická cvičení budou založena na online zdrojích a nástrojích (např. Galaxy). Znalost programování není třeba.
Literatura
Materiály z přednášek a cvičení reflektující aktuální vývoj v oboru.Dostupné na https://sites.google.com/a/natur.cuni.cz/pombe-team/teaching
Garant
RNDr. Martin Převorovský, Ph.D.