Předmět Speciální limnologické metody (MB160C13)

Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu MB160C13 - Speciální limnologické metody, Přírodovědecká fakulta, Univerzita Karlova v Praze (UK).

Materiál	Typ	Datum	Počet stažení

Sylabus

P - přednáška, C - cvičení1) P: Fluorescenční mikroskopie, pojem primární a sekundární fluorescence, specifická vazba fluorochromů. C: Příprava preparátů s nízkou fluorescencí pozadí, barvení DTAF a akridinovou oranží, rozlišení přítomnosti chlorofylu v buňkách mikroorganismů.2) P: Barvení fluorochromy které se vážou na DNA, rozlišení mikroorganismů na prokaryota a eukaryota. C: Barvení DAPI (zvýraznění DNA a jader mikroorganismů), barvení primulinem (zvýraznění povrchových struktur prvoků).3) P: Využití vícenásobného diferenciálního barvení fluorochromy v mikrobiální ekologii, modelový systém predátor-kořist. C: Barvení bakterií DTAF, dobarvení prvoků DAPI, stanovení rychlosti vyžírání bakterií prvoky.4) P: Základy analýzy kinetických dat v biochemii: časové průběhy, saturační kinetika, užívané modely, software. C: Vyhodnocování kinetických dat pomocí počítače.5) P: Spektrofluorometrie, základní principy a využití.C: Seznámení s obsluhou a kalibrací fluorometru, kalibrační křivka methylumbelliferonu (MUF).6) P: Fluorometrické stanovení aktivity extracelulárních enzymů. C: Stanovení aktivity extracelulární fosfatázy a ß-glukosidázy pomocí příslušných MUF-substrátů.7) P: Práce s radioaktivitou: základní pojmy, zákonné normy, vybavení izotopové laboratoře I. kategorie. C: Seznámení s vybavením izotopové laboratoře. Test ze znalostí předpisů pro práci s radioaktivitou (podmínka připuštění k práci s izotopy).8) P: Měření radioaktivity scintilační spektrometrií. Teorie, obsluha a kalibrace scintilačního počítače, vyhodnocování výsledků. C: Seznámení s funkcí a obsluhou scintilačního počítače, kalibrace pomocí externích standardů.9) P: Primární produkce 14C metodou, osud prim. prod. a extracelulární produkce 14C metodou. C: Stanovení primární produkce 14C metodou, část I.10) P: Obrat rozpuštěného ortofosfátu 32P metodou, inkorporace 32P, stanovení dostupného ortofosfátu podle Riglera. C: Stanovení primární produkce 14C metodou, část II.11) P: Bakteriální produkce inkorporací 3H-thymidinu, 3H-leucinu, 35S. C: Stanovení bakteriální produkce inkorporací 3H-thymidinu.12) P: Inkorporace a oxidace 14C značených substrátů (glukóza, acetát...), heterotrofní aktivita dle Hobbie & Wright. C: Inkorporace 14C-glukózy.13) P: Mikroautoradiografie - princip metody, použití značených substrátů (3H, 14C, 32P, 33P) pro planktonní objekty různých velikostí.C: Mikroautoradiografie s 3H-substráty, interpretace výsledků.

Literatura

1. Riemann,B., Sondergaard,M. (Eds): Carbon dynamics in eutrophic, temperate lakes, (248 str.). Elsevier, Amsterdam, 1986.2. Preparation of samples for liquid scintillation counting (a catalog) Nuclear Chicago Corporation, Des Plaines, USA, 1976.3. Sherr B. F., Sherr E.B. and Fallon R. D., 1987. Use of monodispersed, fluorescently labeled bacteria to estimate in situ protozoan bacterivory. Appl. Environ. Microbiol., 53, 958-965.4. Porter K. G. and Feig Y.S., 1980. The use of DAPI for identifying and counting aquatic microflora. Limnol. Oceanogr., 25, 943-948.5. Hobbie,J.E., Daley,R.J. and Jasper,S., 1979: Use of Nuclepore filters for counting bacteria by epifluorescence microscopy. Appl. Environ. Microbiol. 33: 1225-1228.

Požadavky

Zápočet je udělován za aktivní účast na kurzu a vypracované protokoly ze všech úloh.

Garant

prof. RNDr. Jaroslav Vrba, CSc.