Předmět Molekulární fylogenetika a taxonomie (MB160P21)
Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu MB160P21 - Molekulární fylogenetika a taxonomie, Přírodovědecká fakulta, Univerzita Karlova v Praze (UK).
Top 10 materiálů tohoto předmětu
Materiály tohoto předmětu
| Materiál | Typ | Datum | Počet stažení |
|---|
Další informace
Sylabus
Předběžný rozpis pro rok 2015Přednášky budou probíhat v parazitologické posluchárně v čase 11:15-12:459. 10. - Úvod, taxonomie, molekulární znaky, sekvenace DNA (Hampl)16. 10. - Alignment sekvencí (Novotný)23. 10. - Databáze sekvencí a vyhledávání v nich (Novotný)30. 10. - Jiné metody získávání molekulárních dat- multilokusové metody (RAPD, RFPL aj.), mikrosatelity, minisatelity, izoenzymová a alozymová analýza, imunologické metody (Hampl)6. 11. - SNP, evoluce sekvencí, odhad evoluční vzdálenosti (Hampl)13. 11. - Fylogenetické stromy I. - Proteinové distance, konstrukce fylogenetických stromů z matice distancí, anatomie stromů (Hampl)20. 11. - Fylogenetické stromy II. Rate heterogeneity, prohledávání prostoru stromů, maximální parsimonie (Hampl)27. 11. - Fylogenetické stromy III. - Metoda maximum likelihood, Bayéská metoda (Hampl)4. 12. - Fylogenetické stromy IV. - Multigenové analýzy, určení věrohodnosti větvění stromů, nalezení kořene, testy topologie, Datování pomocí molekulárních hodin (Hampl)11. 12. - Identifikace jedinců, určování rodičovství, DNA barcoding (Hampl)18. 12. - Vnitrodruhová fylogeneze, struktura populace a genový tok, fylogeografie, příklady (Hampl)8. 1. - Speciace a hybridizace, kryptické druhy, příklady (Reifová)8. 1. 14:00 - Prezentace studentů
Literatura
Felsenstein J: Inferring phylogenies. Sinauer Associates, Inc., USA, 2004Hillis DM, Moritz C a Mable BK: Molecular Systematics, second edition. Sinauer Associates, Inc., USA, 1996Avise JC. Molecular Markers, Natural History and Evolution, second edition. Sinauer Associates, Inc., USA, 2004
Požadavky
Součásti zkoušky:Písemná část (5 příkladů) - maximální zisk 10 bodůÚstní část - maximální zisk 10 bodůNepovinný esej (2-3 strany) a jeho prezentace (10 min.) - 4 bodyHodnocení:11-13 bodů - dobře14 - 17 bodů - velmi dobře18 a více - výborně
Garant
doc. Mgr. Vladimír Hampl, Ph.D.
Vyučující
doc. Mgr. Vladimír Hampl, Ph.D.Mgr. Marian Novotný, Ph.D.