Předmět Biofyzikální chemie II - experimentální metody (MC260P45)
Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu MC260P45 - Biofyzikální chemie II - experimentální metody, Přírodovědecká fakulta, Univerzita Karlova v Praze (UK).
Top 10 materiálů tohoto předmětu
Materiály tohoto předmětu
| Materiál | Typ | Datum | Počet stažení |
|---|
Další informace
Sylabus
Forma zkoušky: kombinovaná, první část písemný test (nutno získat > 60% bodů), druhá část ústní zkoušení.Sylabus přednášky:1. Základní přehled a srovnání metod studia struktury biopolymerů.2. Krystalizace proteinů, popis krystalu, krystalografická symetrie, krystalové soustavy, základní jednotka, asymetrická jednotka.3. Teorie difrakce. Difrakce na jednom elektronu. Difrakce na atomu. Definice atomového rozptylového faktoru. Definice strukturního faktoru.4. Teorie difrakce. Odvození difrakčních (Laueho) podmínek. Reciproká mřížka. Ewaldova konstrukce. Fázový problém. 5. Řešení fázového problému. Pattersonova mapa a určení polohy těžkých atomů. Principy metod MIR, SIR, SAD, MAD. Princip metody molekulového nahrazení.6. Zpracování a analýza difrakčních dat. Stavba modelu struktury. Metody upřesňování struktury. Analýza strukturního modelu.7. Princip NMR, 2D NMR. Měření COSY a NOESY. Princip získání strukturní informace z NMR dat. 8. Kryoelektronová mikroskopie a její využití v biofyzikální chemii proteinů.9. Metody analytické ultracentrifugace. Metody sedimentačních rychlostí a sedimentační rovnováhy.10. Mikrokalorimetrie. Isotermální titrační kalorimetrie a diferenční skenovací kalorimetrie.11. Povrchová resonance plasmonu (SPR).12. SAXS - nízkoúhlový rozptyl rentgenového záření
Literatura
ZÁKLADNÍ (povinná): Kodíček, M., Karpenko, V.: Biofysikální chemie, Academia, Praha, 2000. Prosser V. a kol.: Experimentální metody biofyziky, Academia, Praha, 1989.Studijní materiály (prezentace z přednášek) jsou dostupné v systému Moodle UK. DOPORUČENÁ: Bergethon, P. R.: The Physical Basis of Biochemistry, Springer Verl., 2010. Cantor, C.R., Schimmel, P.R.: Biophysical Chemistry I-III, W.H. Freeman and Company, San Francisco 1980. Allen, J.P.: Biophysical Chemistry, Wiley-Blackwell, 2008. Cooper, A.: Biophysical Chemistry, The Royal Society of Chemistry, 2004.
Požadavky
Forma zkoušky: kombinovaná, první část zkoušky je písemný test v rozsahu přednášené látky (nutno získat > 60% bodů), druhá část zkoušky je ústní zkoušení v rozsahu přednášené látky.
Garant
prof. RNDr. Tomáš Obšil, Ph.D.