Předmět Počítačové modelování chemických reakcí a enzymové katalýzy (MC260P87)
Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu MC260P87 - Počítačové modelování chemických reakcí a enzymové katalýzy, Přírodovědecká fakulta, Univerzita Karlova v Praze (UK).
Top 10 materiálů tohoto předmětu
Materiály tohoto předmětu
| Materiál | Typ | Datum | Počet stažení |
|---|
Další informace
Sylabus
Přehled metod kvantové chemie a jejich použití v oblastni modelování biomolekulMetody molekulové mechaniky a dynamiky (MM, MD)Statistické vzorkování fázového prostoru a použití MD metod pro výpočty termodynamických veličinKombinované kvantově mechanické a molekulově mechanické (QM/MM) metody - principyKombinované kvantově mechanické a molekulově mechanické (QM/MM) metody - aplikaceTeorie tranzitního stavu - použití a její omezeníMetody výpočtu solvatačních energií - přehledReakce v kondenzované fázi Reakční mechanismy enzymů - obecný přehledReakční mechanismy enzymů - praktické provádění výpočtů
Literatura
A. Warshel: Computer Modeling of Chemical Reactions in Enzymes and Solutions, Wiley, 1997.W. Koch and M. Holthausen: A Chemist’s Guide to DFT, Whiley-VCH, 2000.F. Jensen: Introduction to Computational Chemistry, Wiley, 1999.Christopher J. Cramer: Essentials of Computational Chemistry: Theories and Models, Wiley, 2004.
Požadavky
Zkouška se koná ústní formou, od studenta se požaduje hlubší porozumění studované problematice,tj. základním principům enzymové katalýzy a chemické reaktivity, bez nutnosti detailní znalostivšech rovnic a jejich odvození.
Garant
RNDr. Lubomír Rulíšek, Ph.D.
Vyučující
RNDr. Lubomír Rulíšek, Ph.D.Mgr. Martin Srnec