Předmět Chemická informatika II (MC270P75)
Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu MC270P75 - Chemická informatika II, Přírodovědecká fakulta, Univerzita Karlova v Praze (UK).
Top 10 materiálů tohoto předmětu
Materiály tohoto předmětu
Materiál | Typ | Datum | Počet stažení |
---|
Další informace
Sylabus
1. Správa zdrojového kódu přehled používaných systemů - CVS, SVN, GIT, MERCURIAL... GIT, praktické příklady použití2. Programovacího jazyk Python - úvod práce z příkazové řádky objektový přístup zakladní použití - zpracování textových souborů (.txt, .csv, ..) testování3. Práce s HTML a XML soubory v jazyce Python Python funkce pro internetovou komunikaci automatické stahování stránek/souborů z webovych stranek extrakce údajů z html stránky xml soubory, struktura a použití, xslt transformace4. Python a SQL databáze přehled používaných SQL systémů Python DB API práce s daty5. Chemicky orientované úlohy v jazyce Python chemické strukturní formáty (SMILES, MOL, InChI, InChIKey, cml, ...) Python knihovny pro práci s chemickými strukturami (openbabel, inchi)6. Použití R a Python pro statistické výpočty a generování grafů import datových souborů prokladání funkcí vizualizace - grafy7. Použití Povray pro přípravu grafiky a animací v profesionální kvalitě Povray skripty pro tvorbu 3D grafiky (Ray-tracing)8. Webové aplikace - úvod knihovní funkce Python pro tvorbu webového serveru přehled webových frameworků v jazyce Python (Zope, Pylons, Django, Turbogears, Webware,...) servery poskytující chemické služby9. Tvorba webových aplikací s Django úvod do Django frameworku templátovací jazyk propojení skriptů s webovou aplikací10. Webová aplikace, JavaScript a jQuery tvorba uživatelsky přívětivých AJAX aplikací11. Testování webových aplikací Selenium Django testy
Literatura
moodle.orgchem.czGit http://progit.org/Python http://python.orgR http://www.r-project.org, http://www.r-project.czSQL http://www.w3schools.com/sql/default.asp, http://www.amazon.com/dp/0980455251/Povray http://povray.orgKnime http://knime.orgDjango http://www.djangoproject.orgJ.Gasteiger, T. Engel: Chemoinformatics: A Textbook http://www.amazon.com/Chemoinformatics-Textbook-Johann-Gasteiger/dp/3527306811
Požadavky
Pro udělení zápočtu je nutné každý týden vyřešit úspěšně a včas praktická cvičení k tématům daného týdne.
Garant
doc. RNDr. Jindřich Jindřich, CSc.
Vyučující
doc. RNDr. Jindřich Jindřich, CSc.