Předmět Molekulární metody v ekologii mikroorg. (EKO / MMEM)

Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu EKO / MMEM - Molekulární metody v ekologii mikroorg., Přírodovědecká fakulta, Univerzita Palackého v Olomouci (UP).

Materiál	Typ	Datum	Počet stažení

Obsah

1. Extrakce buněk z environmentálních vzorků (sonikace, Nycodenz), barvení DAPI2. Extrakce DNA pomocí kitu, kontrola na elektroforéze3. Polymerázová řetězová reakce, denaturační gelová gradientová elektroforéza4. Fluorescenční in situ hybridizace, analýza obrazu v programu NIS5. Konstrukce fylogenetických stromů

Získané způsobilosti

Na konci kurzu se očekává, že student bude:- vědět o možnostech využití molekulárních metod v ekologii mikroorganismů- umět používat vybrané molekulární metody- schopen interpretovat výsledky různých studií, zaměřených na detekci mikroorganismů pomocí molekulárních metod

Literatura

Madigan MT, Martinko JM (2006). Brock biology of microorganisms, 11th ed. (nebo pozdější vydání). Pearson Education, Inc., Upper Saddle River, NJ. Brown TA (2007). Klonování a analýza DNA. Univerzita Palackého v Olomouci, 389 pp.. ISBN 978-80-244-1719-6.Osborn M, Smith C (2005)(eds). Molecular microbial ecology. Taylor & Francis, New York, NY. Oren A, Papke RT (2010). Molecular phylogeny of microorganisms. Caister Academic Press, Norfolk, UK. Persing DH, Tenover FC, Tang YW, Nolte FS, Hayden RT, van Belkum A (eds). Molecular microbiology: Diagnostic principles and practice. Washington, 2011. ISBN 978-1-55581-497-7.Rulík M, Buriánková I, Brablcová L. Vybrané kapitoly z molekulární ekologie mikroorganizmů. Olomouc, 2015. ISBN 978-80-244-4642-4.

Požadavky

Zpracování eseje na vybrané téma, zaměřené na problematiku mikrobiální ekologie.

Garant

doc. RNDr. Martin Rulík, Ph.D.

Vyučující

Mgr. Lenka Brablcová, Ph.D.Mgr. Iva Buriánková, Ph.D.doc. RNDr. Martin Rulík, Ph.D.