Předmět Anatomie genomu (KBB / ANGEN)

Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu KBB / ANGEN - Anatomie genomu, Přírodovědecká fakulta, Univerzita Palackého v Olomouci (UP).

Materiál	Typ	Datum	Počet stažení

Obsah

Předmět studia, chromozomální teorie dědičnosti, DNA jako nositelka dědičné informace, struktura DNA, genetický kód, genom eukaryot a prokaryot, velikost genomu, typy sekvencí DNA v genomu Strukturní geny a geny kódující funkční RNA, transkripce, introny a exony, původ intronů, alternativní sestřih, repetitivní sekvence DNA, biologický význam repetitivních sekvencí a jejich patogenicita. Genom prokaryot, eubakterie a archebakterie, příklady sekvenovaných prokaryot. Genom eukaryot, genomy mitochondrií a plastidů, buněčné jádro, chromatin, chromozomální domény, uspořádání chromozómů v jádře, jaderná tělíska, místa replikace DNA. Histonový kód, změny kondenzace chromatinu a regulace genové exprese, umlčování retroelementů, role RNA interference, genomické izolátory. Funkční domény chromozómů, centroméra, neocentroméra, sekundární konstrikce, nukleolární dominance, teloméra, vznik nové teloméry. Pohlavní chromozómy, evoluce pohlavních chromozómů, regulace dávky genů, B chromozómy, imprinting. Izochory, uspořádání genů v genomu, genové ostrovy a pouště, konzervované nekódující sekvence DNA, distribuce repetitivní DNA v genomu, stabilita a variabilita genomů. Evoluce genomů, kolinearita a syntenie, evoluce genovou duplikací, paralogní a ortologní geny, polyploidizace, mezidruhová hybridizace, evoluce repetitivních sekvencí DNA. Poznatky získané sekvenování celých genomů živočichů a rostlin.

Získané způsobilosti

Po absolvování kurzu je student schopen:- Popsat strukturu prokaryotického a eukaryotického genomu.- Popsat strukturu genu, nekódující DNA, a jejich evoluci- Zhodnotit důsledky genomové duplikace a aktivity repetitivní DNA. - Definovat organizaci buněčného jádra a jeho funkci. - Vysvětlit molekulární strukturu funkčních chromozómových domén. - Vysvětlit podstatu epigenetické regulace genů a roli struktury chromatinu- Zhodnotit kriticky vědecké články.

Literatura

ALLIS ,C.D., JENUWEIN, T., REINBERG, D., CAPARROS, M.L. Epigenetics. Cold Spring Harbor Laboratory Press, New York, 2007. ISBN 13: 978-0-87969-7.Lewin, B. Genes VII. Oxford University Press, Oxford, 2000. Brown, T.A. Genomes. John Wiley and Sons, Inc., New York, 1999. Strachan, T., Read, A.P. Human Molecular Genetics. John Wiley and Sons, Inc., New York, 1999. Appels, R. et al. Chromosome Biology. Kluwer Academic Publishers, Dordrecht, 1998. Griffiths, A.J.F., Gelbart, W.M., Miller, J.H., Lewontin, R.C. Modern Genetic Analysis. W.H. Freeman, New York, 1999. Alberts, B., Bray, D., Johnson, A., Lewis, J., Raff, M., Roberts, K., Walter, P. Základy buněčné biologie. Espero Publishing, Ústí nad Labem, 2000.

Požadavky

Pisemny test, 75% spravne odpovezenych otazek

Garant

prof. Ing. Jaroslav Doležel, DrSc.

Vyučující

prof. Ing. Jaroslav Doležel, DrSc.