Předmět Genomika (KBB / PGSB5)

Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu KBB / PGSB5 - Genomika, Přírodovědecká fakulta, Univerzita Palackého v Olomouci (UP).

Materiál	Typ	Datum	Počet stažení

Obsah

Předmět studia genomiky. Obsah genomových projektů.Genetické mapování u rostlin, živočichů a člověka. Mapovací populace. Molekulární markery, jejich typy a charakteristiky, vysokokapacitní markerové systémy.Knihovny DNA dlouhých inzertů, jejich typy a konstrukce.Fyzické mapování, konstrukce fyzických cytogenetických a fyzických molekulárních map. Automatizovaný postup fyzického mapování. Integrace fyzických a genetických map.Poziční klonování genů. Komparativní genomika.Strategie sekvenování DNA (shotgun, clone-by-clone, redukční strategie). Postup celogenomového sekvenování, technologie nové generace. Anotace sekvencí DNA.Jednonukleotidové polymorfismy (SNP), metody jejich objevování a využití pro analýzu genomů.Analýza genové exprese, transkriptom. DNA mikroarraye, jejich příprava a využití.Určování funkce genů. Metody funkční genomiky - saturační přímá genetika, vysoko-kapacitní reverzní genetika, genetika jemné struktury.Genomové projekty u prokaryot, rostlin, živočichů a člověka.

Získané způsobilosti

Student bude schopen- vysvětlit a použít moderní techniky pro studium genomů- orientovat se v problematice a vést vědeckou diskusi v širších souvislostech celého oboru

Literatura

Gibson, G., Muse, V.S. A Primer of Genome Science. Sunderland, 2004. Birren et al. Genome analysis - Mapping Genomes. New York, 1997. Šmarda et al. Metody molekulární biologie. Brno, 2005. Kole, Ch., Abbot, A.G. Principles and Practices of Plant Genomics. Enfield, 2008. Meksem, K., Kahl, G. The Handbook of Plant Genome Mapping. Weinheim, 2005.

Požadavky

Zkouška v rozsahu probíraného učiva.

Garant

Ing. Hana Šimková, CSc.

Vyučující

Ing. Hana Šimková, CSc.