Předmět Analýza transkriptomu a anotace genů (KBC / ATAN)
Na serveru studentino.cz naleznete nejrůznější studijní materiály: zápisky z přednášek nebo cvičení, vzorové testy, seminární práce, domácí úkoly a další z předmětu KBC / ATAN - Analýza transkriptomu a anotace genů, Přírodovědecká fakulta, Univerzita Palackého v Olomouci (UP).
Top 10 materiálů tohoto předmětu
Materiály tohoto předmětu
| Materiál | Typ | Datum | Počet stažení |
|---|
Další informace
Obsah
Nukleové kyseliny a jejich struktura. Přepis molekul DNA do RNA, typy RNA molekul, mRNA, tRNA, rRNA, malé RNA, protismyslné trankripty, definice a charakteristika genů, strukturní, regulační geny, orthologní, paralogní geny, genové rodiny, duplikace, změny počtu kopií genů, strukturní varianty genů, alternativní splicing, evoluce genů, transkripce repetitivní DNA, regulace genové exprese, RNA interference, imprinting genů, modifikace chromatinu. Sekvenování transkriptomu, vyhledávání genů a funkčních domén, nástroje predikce genů, Glimer, GeneMark, GeneScan. Analýza genové exprese, Northern blots, cDNA, microarrays, RT-PCR, SAGE, genové databáze. Validace funkce genů a funkční genomika, transformace genů a metody transgenoze, VIGS, Agrobacterium, mutageneze, TILLING, transposon tagging, TALEN.
Získané způsobilosti
Po absolvování kurzu by student měl být schopen:- rozlišit a definovat různé formy genetické informace- používat nástroje pro analýzu a predikci genů- porozumět metodám ověření funkce genů a transgenoze
Literatura
Gibson, G., Muse, V.S. A Primer of Genome Science. Sunderland, 2004. Šmarda et al. Metody molekulární biologie. Brno, 2005. Kole, Ch., Abbot, A.G. Principles and Practices of Plant Genomics. Enfield, 2008. Kahl, G., Meksem, K. The Handbook of Plant Functional Genomics. Weinheim, 2008. Ondřej M., Drobník J. Transgenoze rostlin. Akademia, 2002.
Požadavky
Úspěšné složení ústní zkoušky
Garant
RNDr. Jan Šafář, Ph.D.
Vyučující
RNDr. Jan Šafář, Ph.D.